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江西凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

來源: 發(fā)布時(shí)間:2025-03-07

GlycOCATCH設(shè)計(jì)用于特異性結(jié)合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。親和樹脂基于無活性的Genovis的OpeRATOR酶,該酶經(jīng)過工程設(shè)計(jì),可以高親和力結(jié)合O-糖基化蛋白和肽。 結(jié)合在pH 5-8的生理緩沖液中進(jìn)行。由于GlycOCATCH樹脂和O-糖蛋白/肽之間的強(qiáng)相互作用,可以用8M尿素進(jìn)行洗脫。或者,可以使用活性O(shè)peRATOR酶進(jìn)行洗脫,該酶消化O-聚糖位點(diǎn)的N末端結(jié)合的O-糖蛋白。在后一種情況下,肽在天然條件下回收。OpeRATOR 凍干酶包含在購(gòu)買中。由于 O-糖蛋白上的旋亞氨酸化 O-聚糖與樹脂結(jié)合效率更高,因此唾液酸酶混合物 SialEXO 凍干也包含在購(gòu)買中。SialEXO酶來源于Akkermansia muciniphila,并在大腸桿菌中表達(dá)。江西凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

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為了研究 OglyZOR 對(duì)天然糖蛋白的活性,將該酶與依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或沒有 SialEXO 孵育 1 小時(shí)。當(dāng)唾液酸被去除時(shí),OglyZOR酶有效地水解了所有三種底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 (Gal-β1,3-GalNAc)。這使得這些酶適合在LC-MS分析之前制備樣品,以鑒定其他PTM或確認(rèn)氨基酸序列O-糖基化生物制藥的全去糖基化:O-糖基化生物制藥(如依那西普)很難表征。為了能夠通過質(zhì)譜法測(cè)定完整質(zhì)量數(shù),我們進(jìn)行了酶促總?cè)ヌ腔-聚糖被Genovis的PNGase F裂解,而O-聚糖可以與OglyZOR和SialEXO一起去除。。上海高活性/無非特異酶活PNGaseF去糖基化酶生物藥物開發(fā)OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖。

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Genovis 是一家瑞典生物技術(shù)公司,自2010年起,為生物制藥公司提供SmartEnzymes?工具酶。Genovis提供一系列獨(dú)特、快速且易于使用的酶學(xué)工具,主要用于生物制藥行業(yè)和學(xué)術(shù)界。 我們?cè)谌蚍秶鷥?nèi)提供創(chuàng)新的智能酶SmartEnzymes?,用于單克隆抗體、ADC、生物仿制藥和雙特異性生物藥物的開發(fā)、生產(chǎn)和質(zhì)量控制。您可以在我們的網(wǎng)站上“Application頁(yè)面”獲得更多應(yīng)用信息,如果您有興趣,可以和我們一起做一個(gè)“SmartStories”,也可以聯(lián)系我們。?

為了證明Genovis的PNGase F凍干和PNGase F固定在各種底物上的去糖基化能力,用PNGase F凍干或PNGase F固定化處理了一系列糖蛋白。使用天然反應(yīng)條件在一小時(shí)內(nèi)有效去除曲妥珠單抗和依那西普上的所有N-糖,以及西妥昔單抗上的Fc-糖。當(dāng)加入RapiGest?并在變性條件下進(jìn)行反應(yīng)時(shí),西妥昔單抗的所有N-聚糖(包括Fab-聚糖)在PNGase F固定化10分鐘內(nèi)完全去除,PNGase F固定化15分鐘內(nèi)完全去除。在變性反應(yīng)條件下,PNGase F 在 30 分鐘內(nèi)成功將更復(fù)雜的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用變性和還原反應(yīng)條件,將常用的糖蛋白標(biāo)準(zhǔn)品RNase B在10或15分鐘內(nèi)完全去糖基化,分別使用PNGase F凍干或PNGase F固定化。在天然和變性條件下生成的去糖基化樣品與LC-MS分析兼容。PNGase F Automation 含有以自動(dòng)化友好的 96 孔板形式凍干的 PNGase F 酶。

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α連接的Genovis的GalNAcs的水解:GalNAcEXO 是一種 α-N-乙酰半乳糖胺苷酶,可有效水解糖蛋白上的末端 GalNAc 殘基。與絲氨酸或蘇氨酸連接的 GalNAc(稱為 Tn 抗原)被 GalNAcEXO 快速有效地水解,并且該酶還在 α1-3 連接的末端 GalNAcs 上顯示出活性。Genovis的GalNAcEXO 是一種外α-N-乙酰半乳糖胺酶,用于有效水解與糖蛋白(Tn 抗原)中的絲氨酸或蘇氨酸殘基相連的 α-N-乙酰半乳糖胺 (GalNAc)。該酶還在 α1-3 連接的末端 GalNAc 上顯示活性。GalNAcEXO 在天然條件下水解糖蛋白上的 GalNAc,在 pH 值 6.0 至 7.6 范圍內(nèi)具有高度活性。曲妥珠單抗中半乳糖損失的LC-MS數(shù)據(jù),進(jìn)行了釋放的N-聚糖分析。江蘇凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶

FucosEXO凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在2000單位的小瓶中,用于2mg糖蛋白的去碳基化。江西凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究

與PNGase F類似,Genvois的OmniGLYZOR用于攜帶N-和簡(jiǎn)單O-糖的糖蛋白的去糖基化。 OmniGLYZOR 試劑盒包括:OmniGlyZOR 微離心柱;PNGase F 凍干;RapiGest?* SF表面活性劑。除非底物蛋白變性,否則某些 N-糖基化位點(diǎn)很難或無法被 PNGase F 接近。在OmniGLYZOR Microspin柱上孵育后剩余的N-糖可以在變性條件下使用試劑盒中包含的PNGase F凍干和RapiGest? SF表面活性劑通過額外的去糖基化步驟去除。使用Genovis的OpeRAT對(duì)EPO進(jìn)行O-糖位點(diǎn)特異性消化:對(duì)于jin攜帶一個(gè)或幾個(gè) O-糖基化位點(diǎn)的簡(jiǎn)單底物蛋白,OpeRATOR 也可用于繪制中間水平的 O-糖基化位點(diǎn)。 江西凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究