病毒宏基因組學應用：病毒宏基因組學已經(jīng)應用到人類、動物和環(huán)境中，涉及到農(nóng)業(yè)、工業(yè)及畜牧業(yè)等各個領域，其應用范圍已延伸到海洋、湖水、熱泉、下水道等無機環(huán)境，以及組織病料、血液、呼吸道、動物排泄物等有機環(huán)境。應用病毒宏基因組學的方法研究佛羅里達綠海龜?shù)睦w維狀瘤組織中發(fā)現(xiàn)了單鏈DNA病毒（Seaturtletornovirus1，STTV1）。分析了來自馬里蘭淡水湖中的RNA病毒宏基因組，結果獲得淡水湖中30多個RNA病毒家族序列，其中包含小RNA病毒、小雙股病毒及正黏病毒等。高通量測序技術對核酸進行測序是非特異的，因此,對一無所知的核酸也可以實現(xiàn)鑒別.北京口腔微生物測序方法

目前構建的病毒宏基因組學文庫主要有載體克隆文庫和基于高通量測序技術的加接頭的文庫。隨著深度測序技術的不斷發(fā)展，第二代高通量測序技術、第三代單分子測序技術已經(jīng)普遍地應用于各項研究領域中，以454測序技術和Illumina測序技術為表示的二代測序法得到迅速推廣用于構建病毒宏基因組文庫，相信將來第三代測序平臺如tSMSTM（truesinglemolecularsequeneing）技術平臺、SMRT（singlemoleculereal-time）技術平臺、FRET測序技術及納米孔單分子技術為表示的第三代測序法也將應用于構建病毒宏基因組文庫。Donaldson等[23]采用高通量測序技術構建了蝙蝠腸道的病毒宏基因組學文庫，獲得了600000條讀長（Reads）的核酸序列。河南病毒宏基因組分析上哪找微生物鑒定可以用微生物對噬菌體的敏感性作為指標來鑒定微生物的種屬。

探普生物對樣本進行宏病毒組測序實驗基于二代測序技術。經(jīng)過核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這3大基本流程后，樣本轉換成了序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對病毒的核酸純化樣本指南，以提高純度和得率，與此同時探普生物也提供核酸純化服務。第二，文庫構建環(huán)節(jié)。樣本的核酸具備濃度低，總量少的特點。探普生物專門針對這一點開發(fā)了超微量核酸文庫構建，可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構建成測序文庫。第三，生物信息學分析環(huán)節(jié)。寄生性質的生物下機數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，搭載了專門用的的生物信息學分析流程，可處理復雜背景下的目標物種序列。

上海探普生物科技有限公司對樣本進行宏病毒組測序有什么優(yōu)勢？全國開設病毒宏基因組測序的公司不超過3家，只有探普生物是專門為病毒研究者服務的，探普生物的研發(fā)團隊和實驗團隊都來自全國各地病毒學、微生物學專業(yè)的高校，碩士及以上學歷成員超過60%，團隊具備普通測序實驗和分析基礎之外，同時具備病毒學及微生物學的學術背景，相當了解病毒相關樣本情況、研究方向等。研究者在項目咨詢的時候就可以明顯感覺到探普生物的專業(yè)性，溝通順暢，省時又省力。宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進行分離培養(yǎng)。

病毒宏基因組測序的研究案例：噬菌體是糞便病毒組的主要成員，糞便病毒組移植（FVT）或能有效的調節(jié)腸道菌群。在該項概念驗證試驗中發(fā)現(xiàn)，接受瘦小鼠的糞便病毒組移植后，飼喂高脂食物的小鼠體重增長變慢，同時還能保持正常的血糖指標，F(xiàn)VT引起的腸道菌群變化介導了這些保護性功能代謝作用。這項研究表明，F(xiàn)VT療法或能用來改善肥胖和糖尿病等腸道菌群相關代謝類疾病。對噬菌體不造成損傷，大程度保證了病毒活性，適用于下游FVT研究。宏病毒組學(ViralMetagenomics)是宏基因組學的一個分支，但與傳統(tǒng)的宏基因組學概念不同，它是在宏基因組學概念的基礎上，結合病毒自身的特點，將宏基因組學方法應用到病毒學領域而形成的。隨著醫(yī)學微生物學研究技術的不斷發(fā)展，病原學診斷已不再局限于病原體水平。四川口腔微生物多樣性分析

微生物鑒定的用途：醫(yī)療保?。簻蚀_、快速地鑒定細菌和寄生蟲,以進行正確和及時的疾病診斷。北京口腔微生物測序方法

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