宏基因組是指特定環(huán)境中全部微生物遺傳物質的總和，宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個微生物群落作為研究的對象，不需對微生物進行分離培養(yǎng)，而是提取環(huán)境微生物總DNA進行研究。其擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術限制，在基因組水平解讀微生物群體的多樣性和豐度，探索微生物與環(huán)境及宿主之間的關系。目前，第二代高通量測序技術在宏基因組的研究上已被普遍應用。第二代高通量測序平臺具有通量高、準確性高、速度快、信息全等特點，加快了宏基因組測序在鑒定低豐度的微生物群落，挖掘更多基因資源方面的應用。高通量測序技術對核酸進行測序是非特異的，因此，對一無所知的核酸也可以實現(xiàn)鑒別.廣東水體微生物分析

宏基因組的應用：特定生物種基因組研究使人們的認識單元實現(xiàn)了從單一基因到聚合基因的轉變，宏基因組研究將使人們擺脫物種界限，揭示更高更復雜層次上的生命運動規(guī)律。在目前的基因結構功能認識和基因操作技術背景下，細菌宏基因組成為研究和開發(fā)的主要對象。細菌宏基因組細菌人工染色體文庫篩選和基因系統(tǒng)學分析使研究者能更有效地開發(fā)細菌基因資源，更深入地洞察細菌多樣性。如宏基因組成為生物催化劑的新來源。病毒宏基因組測序是指通過高通量測序對整個環(huán)境中的病毒進行研究，以獲得單個樣品的飽和數(shù)據(jù)量，可進行病毒群體的物種分類、復雜度分析、群體結構分析、功能注釋、樣品間的病毒種類或基因差異分析。宏基因組測序研究擺脫了對病毒分離培養(yǎng)的限制，為環(huán)境中各種病毒的研究提供了有效工具，并可以通過宏基因組深度測序挖掘具有應用價值的基因資源。

上海微生物多樣性測序分析微生物鑒定可以采用不同微生物對周圍環(huán)境的資源的利用度有所不同的特性來區(qū)別。

探普生物的病毒測序：由于探普生物具備處理大量多樣的病毒樣本的經(jīng)驗，熟知各類病毒樣本的特性，因此對于樣本準備有獨特的方法指南，這就為后續(xù)的分析結果打下了牢固的基礎，減少了客戶和公司之間的摩擦，也幾乎沒有售后問題。獨有的實驗和分析流程可兼容高復雜度低濃度的病毒核酸。因此探普生物的病毒測序結果質量有保障外還具備：樣本準備簡單，商務流程通暢，回復消息及時，反饋處理迅速等優(yōu)點。我國經(jīng)濟進入“新常態(tài)”，總體上推動["病毒測序","病毒全基因組測序","病毒宏基因組測序","未知病原鑒定"]從粗放式增長向注重質量、效率方向轉變。

病毒宏基因組測序注意事項：探普生物對樣本進行宏病毒組測序實驗基于二代測序技術。經(jīng)過核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這3大基本流程后，樣本轉換成了序列數(shù)據(jù)。先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對病毒的核酸純化樣本指南，以提高純度和得率，與此同時探普生物也提供核酸純化服務。第二，文庫構建環(huán)節(jié)。樣本的核酸具備濃度低，總量少的特點。探普生物專門針對這一點開發(fā)了超微量核酸文庫構建，可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構建成測序文庫。第三，生物信息學分析環(huán)節(jié)。寄生性質的生物下機數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫，搭載了專門用的的生物信息學分析流程，可處理復雜背景下的目標物種序列。可利用不同底物產(chǎn)生的不同代謝產(chǎn)物來間接檢測該微生物內酶的有無,從而達到檢測特定微生物的目的.

宏基因組測序技術注意事項：傳統(tǒng)微生物檢測由于時間長、陽性率低、檢測目標單一，限制了傳染疾病的診治。宏基因組測序技術不依賴于微生物的分離培養(yǎng)，克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術限制，為研究和開發(fā)利用占微生物種類99%以上的未可培養(yǎng)的微生物提供了一種新的途徑和良好的策略。宏基因組測序以無需純化培養(yǎng)、能夠快速全方面的展示序列信息的優(yōu)勢，逐步在臨床上得到了普遍應用。病原宏基因組測序檢測出病原體并報告相應被檢測出的序列數(shù)，再依據(jù)大數(shù)據(jù)庫判定是否為致病病原體。然而不同的測序平臺采用不同的數(shù)據(jù)庫，再由不同的研發(fā)、臨床和檢驗**解讀，缺乏統(tǒng)一標準，結果也會出現(xiàn)差異。因此仍需將病原宏基因組測序檢測數(shù)據(jù)和臨床更好的結合，從而更準確鑒定致病病原體。微生物鑒定的用途：醫(yī)療保?。簻蚀_、快速地鑒定細菌和寄生蟲，來進行正確和及時的疾病診斷。上海水體微生物分析診斷

宏基因組測序逐步在臨床上得到了很多的應用。廣東水體微生物分析

宏基因組學或元基因組（metagenomics），其定義為“Thecollectivegenomesofsoilmicroflora”。該學科可追溯到第1次提出環(huán)境基因組學的概念，在對太平洋浮游生物進行系統(tǒng)分類時構建了第1個噬菌體文庫，并發(fā)現(xiàn)了15種全新的細菌序列。宏基因組學概念是“土壤中所有微生物基因組的總和”命名為土壤宏基因組，系統(tǒng)給出了宏基因組的概念，提出針對特定環(huán)境樣品中遺傳物質總和進行非培養(yǎng)研究。對宏基因組進一步概括為“應用現(xiàn)代的分子生物學技術直接從環(huán)境中獲取的目的微生物群落基因組，叫宏基因組”。廣東水體微生物分析