宏基因組的應(yīng)用：特定生物種基因組研究使人們的認識單元實現(xiàn)了從單一基因到聚合基因的轉(zhuǎn)變，宏基因組研究將使人們擺脫物種界限，揭示更高更復雜層次上的生命運動規(guī)律。在目前的基因結(jié)構(gòu)功能認識和基因操作技術(shù)背景下，細菌宏基因組成為研究和開發(fā)的主要對象。細菌宏基因組細菌人工染色體文庫篩選和基因系統(tǒng)學分析使研究者能更有效地開發(fā)細菌基因資源，更深入地洞察細菌多樣性。如宏基因組成為生物催化劑的新來源。病毒宏基因組測序是指通過高通量測序?qū)φ麄€環(huán)境中的病毒進行研究，以獲得單個樣品的飽和數(shù)據(jù)量，可進行病毒群體的物種分類、復雜度分析、群體結(jié)構(gòu)分析、功能注釋、樣品間的病毒種類或基因差異分析。宏基因組測序研究擺脫了對病毒分離培養(yǎng)的限制，為環(huán)境中各種病毒的研究提供了有效工具，并可以通過宏基因組深度測序挖掘具有應(yīng)用價值的基因資源。未知病原微生物樣本需要經(jīng)歷：核酸純化-文庫構(gòu)建-以及生物信息學分析這三大基本流程才能完成鑒定。微生物多樣性分析要多久

目前構(gòu)建的病毒宏基因組學文庫主要有載體克隆文庫和基于高通量測序技術(shù)的加接頭的文庫。隨著深度測序技術(shù)的不斷發(fā)展，第二代高通量測序技術(shù)、第三代單分子測序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項研究領(lǐng)域中，以454測序技術(shù)和Illumina測序技術(shù)為表示的二代測序法得到迅速推廣用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫，相信將來第三代測序平臺如tSMSTM（truesinglemolecularsequeneing）技術(shù)平臺、SMRT（singlemoleculereal-time）技術(shù)平臺、FRET測序技術(shù)及納米孔單分子技術(shù)為表示的第三代測序法也將應(yīng)用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫。Donaldson等[23]采用高通量測序技術(shù)構(gòu)建了蝙蝠腸道的病毒宏基因組學文庫，獲得了600000條讀長（Reads）的核酸序列。四川病毒多樣性測序分析公司對病毒全基因組進行測序,利用生物信息分析手段，得到病毒的全基因組序列。

對樣本進行宏病毒組測序具有的意義：和細菌的宏基因組相似，病毒宏基因組也是旨在研究微生物群體中的物種分布規(guī)律和差異，通過大數(shù)據(jù)分析微生物群體的功能。通過對樣本進行宏病毒組測序，我們可以了解單個樣本里有什么病毒，相對含量是多少，優(yōu)勢物種是什么；還可以了解不同群體間物種分布有何差異，結(jié)合樣本來源和其所屬環(huán)境，指導下游的實驗方向。于科研，好的群體和樣本可以發(fā)表質(zhì)量的學術(shù)論文；于臨床，可以輔助臨床醫(yī)生進行微生物侵染類疾病診斷并在一定程度提供用藥指導。隨著數(shù)據(jù)庫日趨完善，對樣本進行宏病毒組測序以后，我們將獲得越來越豐富的信息，它有朝一日會成為研究者非常常規(guī)的研究手段。

病毒宏基因組測序：宏基因組測序?qū)Νh(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進行提取和高通量測序，分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息，分析微生物群體基因組及功能，也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系，發(fā)掘和研究新的功能基因。生物信息分析內(nèi)容1.測序質(zhì)量分析與統(tǒng)計、評估；2.數(shù)據(jù)庫比對；3.物種豐度分析；4.功能基因注釋；5.基因功能豐度差異分析；6.Pathway富集分析；7.豐度差異基因/物種聚類分析；8.PCA分析。高通量測序技術(shù)對核酸進行測序是非特異的，因此，對一無所知的核酸也可以實現(xiàn)鑒別.

優(yōu)化臨床制備病毒宏基因組測序所用樣本的方法：①介紹高通量病毒宏基因組測序的樣本制備步驟，對臨床樣本的總核酸進行隨機擴增；②檢測了從血漿樣本中富集/擴增DNA及RNA病毒的不同方法，一種包括過濾、核酸酶消化、在不同反應(yīng)中隨機擴增DNA及RNA的步驟是較好的；③隨后在包含了不同病毒科的樣本中驗證此方法，可高讀數(shù)地檢測到大多數(shù)病毒序列，且優(yōu)于現(xiàn)行的其它樣本制備方法；④該方法不只適用于血漿樣本，還可用于尿液、咽喉拭子等臨床樣本?？焖贆z測方法是指從樣品制備到出具檢測結(jié)果的整個檢測過程中能夠在短時間內(nèi)完成的檢測方法。深圳腸道微生物分析要多久

微生物鑒定可以用微生物對噬菌體的敏感性作為指標來鑒定微生物的種屬。微生物多樣性分析要多久

在政策促進下，未來將在醫(yī)藥、保養(yǎng)短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心、高層次的人才培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺，培育一批品牌優(yōu)勢明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團。根據(jù)病毒測序，病毒全基因組測序，病毒宏基因組測序，未知病原鑒定相關(guān)領(lǐng)域極新技術(shù)發(fā)展趨勢，《2019年本》在鼓勵類條目中新增了技術(shù)開發(fā)和應(yīng)用的有關(guān)內(nèi)容。例如，在化學原料藥領(lǐng)域增加了“連續(xù)反應(yīng)”等技術(shù)，在技術(shù)領(lǐng)域增加了“基因醫(yī)治”和“抗體偶聯(lián)”等技術(shù)，在藥用包裝材料領(lǐng)域增加了“中性硼硅藥用玻璃”等材料與技術(shù)的開發(fā)應(yīng)用，在醫(yī)藥領(lǐng)域增加了“人工智能輔助醫(yī)藥設(shè)備”等新技術(shù)內(nèi)容。微生物多樣性分析要多久