需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的應(yīng)用場(chǎng)景:在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。
對(duì)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序,是利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列.安徽病毒全序列方法
高通量測(cè)序技術(shù)具有的作用:高通量測(cè)序技術(shù)在冠狀病毒的鑒定中發(fā)揮了重要作用,先通過(guò)該技術(shù)確認(rèn)了該病原為以前未知的β冠狀病毒,其次確認(rèn)了該病毒與蝙蝠相關(guān)冠狀病毒ZC45和ZXC21密切相關(guān),同源性約為88%,后高通量測(cè)序?yàn)楹罄m(xù)的診斷提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支撐。高通量測(cè)序能否定向檢測(cè)細(xì)菌病毒等微生物?例如某人有皮膚病,提取組織,能否通過(guò)高通量測(cè)序來(lái)檢測(cè)后列出所有的致病菌。或者當(dāng)懷疑的時(shí)候,在人體組織中檢測(cè)是否有某種特定的細(xì)菌或者病毒。(不求原理),就是想知道現(xiàn)在的測(cè)序技術(shù)能否替代傳統(tǒng)臨床檢驗(yàn)方法。相比傳統(tǒng)培養(yǎng)等方法,對(duì)樣本的全微生物檢測(cè),或者特定微生物檢測(cè),基因測(cè)序技術(shù)目前的時(shí)間消耗,準(zhǔn)確率,和金錢(qián)成本大概如何??梢远ㄏ驒z測(cè),用特異引物就可以。
國(guó)內(nèi)高通量測(cè)序服務(wù)公司病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序以保證比較好的質(zhì)量進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。
能實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的技術(shù)手段:早期在高通量測(cè)序技術(shù)普及之前,對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是通過(guò)非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來(lái)完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過(guò)特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高,讀長(zhǎng)很長(zhǎng),但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無(wú)法通用,該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試,開(kāi)發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序,該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。
深度測(cè)序技術(shù)對(duì)社會(huì)的影響:深度測(cè)序技術(shù)促進(jìn)了基因檢測(cè)的普及,對(duì)社會(huì)的影響第1個(gè)方面反映在商業(yè)模式的變化,即醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)和健康管理方面的平民化、個(gè)性化趨勢(shì)的形成。社會(huì)生活受到深度測(cè)序技術(shù)影響的第二個(gè)方面是基因測(cè)序的普遍應(yīng)用。例如,基因關(guān)聯(lián)將人與人通過(guò)遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)起來(lái),人們可以對(duì)基因進(jìn)行分析判定親緣關(guān)系,基因測(cè)定甚至可以幫助判定婚姻(包括遺傳病等方面的)匹配度。公安機(jī)關(guān)可以通過(guò)基因比對(duì),鎖定犯罪嫌疑人、尋找丟散的兒童和親人。甚至有報(bào)道表明,測(cè)定20多個(gè)基因就可以將人臉重構(gòu)?;驒z測(cè)的應(yīng)用將隨著基因-表型的關(guān)聯(lián)得到更普遍的應(yīng)用,對(duì)社會(huì)生活的方方面面起到重要作用。
二代測(cè)序單次運(yùn)行可以獲得海量的數(shù)據(jù)量,因此也稱(chēng)為高通量測(cè)序。
病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):1.不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡;2.無(wú)需培養(yǎng)和特異性擴(kuò)增,對(duì)采集臨床樣本直接檢測(cè);3.獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析,使病原診斷更準(zhǔn)確;4.與臨床各領(lǐng)域有名**共同打造呼吸道系統(tǒng)、神經(jīng)內(nèi)科系統(tǒng)和血流系統(tǒng)傳染病原數(shù)據(jù)庫(kù),更加貼合需求;5.采用高通量測(cè)序儀,全流程質(zhì)控,結(jié)果穩(wěn)定可靠;6.整體檢出率陽(yáng)性率較傳統(tǒng)方法提升25~30%:肺泡灌洗液檢出率60~80%,腦脊液檢出率40~60%,血液檢出率40~60%;7.專(zhuān)業(yè)化服務(wù):臨床微生物**出具報(bào)告,專(zhuān)業(yè)醫(yī)學(xué)團(tuán)隊(duì)報(bào)告解讀。針對(duì)疑難報(bào)告,由**進(jìn)行深度解析;8.完善的售后服務(wù):基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺(tái),致力于解決臨床的每一個(gè)疑問(wèn)。
病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析.國(guó)內(nèi)高通量測(cè)序服務(wù)公司
想要通過(guò)高通量測(cè)序獲得病毒全序列,需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這三大基本流程.安徽病毒全序列方法
需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的應(yīng)用場(chǎng)景:在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。
安徽病毒全序列方法