病毒宏基因組測序:在運用宏基因組測序方法檢測的樣本量位居全球前列,樣本總數(shù)居國內第二,其中腦脊液檢測量位列全球前二強。除了傳染病的應用場景之外,利用mNGS還可以對菌群進行菌株鑒定分型、耐藥基因與毒力基因的檢測,適用于抗傳染院內傳染管理的評估。在越來越多的證據(jù)表明微生物對人體免疫系統(tǒng)能夠產(chǎn)生影響,以及微生物菌群會參與到神經(jīng)退行性疾病、糖尿病等疾病的發(fā)生和發(fā)展當中,微生物療法獲得了越來越多的關注,而mNGS未來也可以為人們深入分析人體菌群微生態(tài)、研究微生物療法提供一種可靠的技術手段。病毒是一種非細胞生命形態(tài),它由一個核酸長鏈和蛋白質外殼構成。腸道微生物測序原理
病原微生物二代測序也稱宏基因組測序(mNGS)是目前臨床上針對病原較常用的基因測序方法。通過對疑似傳染標本采集提取后(無需培養(yǎng))直接進行高通量測序,利用病原微生物數(shù)據(jù)庫比對和分析后可以獲得疑似致病微生物種屬信息。基于NGS的宏基因組學檢測技術在2014年被用于臨床傳染患者的病原學診斷。目前,多個省市已經(jīng)將病原微生物二代測序納入醫(yī)保報銷,助力病毒檢測!目前,國家微生物科學數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)資源總量已超過300TB,數(shù)據(jù)記錄數(shù)超過了40億條??捎糜谂R床的微生物數(shù)據(jù)庫包括了超過18000條信息。深圳土壤微生物多樣性測序哪家好傳統(tǒng)病原微生物檢測方法是生化方法。
探普生物的病毒測序:由于探普生物具備處理大量多樣的病毒樣本的經(jīng)驗,熟知各類病毒樣本的特性,因此對于樣本準備有獨特的方法指南,這就為后續(xù)的分析結果打下了牢固的基礎,減少了客戶和公司之間的摩擦,也幾乎沒有售后問題。獨有的實驗和分析流程可兼容高復雜度低濃度的病毒核酸。因此探普生物的病毒測序結果質量有保障外還具備:樣本準備簡單,商務流程通暢,回復消息及時,反饋處理迅速等優(yōu)點。我國經(jīng)濟進入“新常態(tài)”,總體上推動["病毒測序","病毒全基因組測序","病毒宏基因組測序","未知病原鑒定"]從粗放式增長向注重質量、效率方向轉變。
宏基因組是指特定環(huán)境中全部微生物遺傳物質的總和,宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進行分離培養(yǎng),而是提取環(huán)境微生物總DNA進行研究。其擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術限制,在基因組水平解讀微生物群體的多樣性和豐度,探索微生物與環(huán)境及宿主之間的關系。目前,第二代高通量測序技術在宏基因組的研究上已被普遍應用。第二代高通量測序平臺具有通量高、準確性高、速度快、信息全等特點,加快了宏基因組測序在鑒定低豐度的微生物群落,挖掘更多基因資源方面的應用。面對未知病毒,抵抗力是我們健康的屏障。
病原體-宏基因組的測序:1.開發(fā)了一種經(jīng)過驗證的臨床mNGS檢測方法,用于在許可的微生物實驗室中診斷腦脊髓液(CSF)引起的腦膜炎和腦炎的傳染原因。2.開發(fā)了定制的生物信息學管道SURPI+,以快速分析mNGS數(shù)據(jù),生成檢測到的病原體的自動摘要,并提供用于評估和解釋結果的圖形用戶界面。3.mNGS提供了一種全方面的方法,通過該方法可以在一次測定中準確鑒定幾乎所有潛在病原體-病毒,細菌,寄生蟲。4.將mNGS測試遷移到臨床微生物學實驗室仍然面臨許多挑戰(zhàn):1、缺乏用于mNGS臨床驗證的既定藍圖;2、難以將病原體從殖民者或污染物中區(qū)分開;3、缺乏專為臨床診斷使用的生物信息學軟件;4、注重質量和全方面性的可獲得的參考數(shù)據(jù)庫;5、臨床實驗室改進修正案(CLIA)環(huán)境中,患者診斷測試固有的法規(guī)遵從性要求微生物鑒定的用途:醫(yī)療保健:準確,快速地鑒定細菌和寄生蟲,以進行正確和及時的疾病診斷。四川微生物多樣性測序原理
隨著醫(yī)學微生物學研究技術的不斷發(fā)展,病原學診斷已不再局限于病原體水平。腸道微生物測序原理
新發(fā)人畜共患病呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢,人類想要征服新發(fā)人畜共患病,就必須提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原,并針對新病原進行基因組分析、流行病學調查、致病機制及疫苗開發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學是在宏基因組學基礎上發(fā)展起來研究特定環(huán)境中病毒的新興技術,該技術結合深度測序技術(第二代、第三代測序技術)已經(jīng)在人類、動物、特定環(huán)境中挖掘出大量的新病毒,該技術不依賴于病毒培養(yǎng)及病毒序列,在國內外被普遍應用于新發(fā)人畜共患病病原的挖掘與臨床診斷。就病毒宏基因組學在動物病毒研究中的應用及研究進展進行了介紹。
腸道微生物測序原理
上海探普生物科技有限公司在病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定一直在同行業(yè)中處于較強地位,無論是產(chǎn)品還是服務,其高水平的能力始終貫穿于其中。公司成立于2018-10-30,旗下探普,已經(jīng)具有一定的業(yè)內水平。公司承擔并建設完成醫(yī)藥健康多項重點項目,取得了明顯的社會和經(jīng)濟效益。產(chǎn)品已銷往多個國家和地區(qū),被國內外眾多企業(yè)和客戶所認可。