深度測序技術(shù)稱為深度測序(deepsequencing),是因?yàn)樗菍鹘y(tǒng)測序技術(shù)的一次性改變,它通過一次性對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定(之前只是幾十至多幾千個(gè)堿基),同時(shí),如此的高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全方面的分析成為可能。你以為深度測序只是一種“養(yǎng)”在實(shí)驗(yàn)室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術(shù)?錯(cuò)!錯(cuò)!錯(cuò)!深度測序技術(shù)的巨大發(fā)展,與計(jì)算機(jī)的發(fā)展歷程有著類似之處,它將對人類的科學(xué)、經(jīng)濟(jì)和社會三個(gè)方面產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。傳統(tǒng)Sanger測序相比,NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個(gè)小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列。長沙全基因組病毒測序原理
探普生物進(jìn)行病毒基因組測序的流程:在探普生物進(jìn)行病毒基因組測序非常簡單,簡而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款,探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測序報(bào)告;5)客戶支付項(xiàng)目尾款,探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問題處理,項(xiàng)目結(jié)題。廣州病毒全序列測序分析價(jià)格病毒全基因組測序具有的特點(diǎn):獨(dú)有的一定定量技術(shù),實(shí)現(xiàn)病原定量分析。
上海探普生物科技有限公司的對病毒的全基因組進(jìn)行測序有什么優(yōu)勢?全國開設(shè)病毒相關(guān)測序的公司不超過5家,只有探普生物是專門為病毒研究者服務(wù)的,探普生物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)和實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)都來自全國各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專業(yè)的高校,碩士及以上學(xué)歷成員超過60%,團(tuán)隊(duì)具備普通測序?qū)嶒?yàn)和分析基礎(chǔ)之外,同時(shí)具備病毒學(xué)及微生物學(xué)的學(xué)術(shù)背景,相當(dāng)了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項(xiàng)目咨詢的時(shí)候就可以明顯感覺到探普生物的專業(yè)性,溝通順暢,省時(shí)省力。
深度測序與個(gè)性化醫(yī)學(xué)的范式相比,P4醫(yī)學(xué)更強(qiáng)調(diào)早期預(yù)測和預(yù)防,強(qiáng)調(diào)對患者了解的系統(tǒng)性和參與性。準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)的概念則是在基因測序普及的基礎(chǔ)上,將整個(gè)個(gè)體的各種信息如生理信息(通過可穿戴設(shè)備可以即時(shí)監(jiān)控和收集到)和腸道菌群變化、各種組學(xué)信息(深度測序測定)整合,進(jìn)行準(zhǔn)確的疾病分型、調(diào)整和預(yù)防。隨著老年化時(shí)代的到來及臨床資源的限制,基于這三種范式的健康管理和準(zhǔn)確診療將成為生物醫(yī)學(xué)研究與應(yīng)用的基本范式,走向大眾生活,正如當(dāng)年的計(jì)算機(jī)發(fā)展歷程一樣,會從原來的大型機(jī)器演變成可移動(dòng)的小型工具。醫(yī)學(xué)與健康的將來也會隨著深度測序的普及和生物信息學(xué)數(shù)據(jù)處理能力的大幅度提高,而進(jìn)入個(gè)性化的大眾管理時(shí)代。在探普生物進(jìn)行病毒基因組測序非常簡單。
一直以來,病毒基因組測序都是疾病診斷、流行病學(xué)調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。病毒的全基因組測序以及對應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進(jìn)化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系、疫病傳播途徑、不同遺傳變異的分布模式、疫病發(fā)生地理區(qū)域的基礎(chǔ)。與傳統(tǒng)Sanger測序相比,NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個(gè)小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列,測序成本也在逐步降低。由于NGS產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量非常龐大,其序列拼接難度也隨之增加。而且對于低濃度高復(fù)雜度的樣本,研究者除了PCR外別無他法。而PCR方法往往具有偏好性,丟失的片段將為序列組裝帶來非常高的失敗率。對于完全未知的樣本,無法通過PCR進(jìn)行富集,要鑒定其種類需要調(diào)用各種方法,逐個(gè)嘗試工作量之大,其效率之低,使得一個(gè)新的研究方法的出現(xiàn)及其必要。病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序幾個(gè)層面。北京深度測序分析價(jià)格
高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次性的改變。長沙全基因組病毒測序原理
高通量基因組測序中,什么是測序深度和覆蓋度?測序深度是指測序得到的總堿基數(shù)與待測基因組大小的比值。假設(shè)一個(gè)基因大小為2M,測序深度為10X,那么獲得的總數(shù)據(jù)量為20M。覆蓋度是指測序獲得的序列占整個(gè)基因組的比例。由于基因組中的高GC、重復(fù)序列等復(fù)雜結(jié)構(gòu)的存在,測序終拼接組裝獲得的序列往往無法覆蓋有所的區(qū)域,這部分沒有獲得的區(qū)域就稱為Gap。例如一個(gè)細(xì)菌基因組測序,覆蓋度是98%,那么還有2%的序列區(qū)域是沒有通過測序獲得的。長沙全基因組病毒測序原理
上海探普生物科技有限公司位于放鶴路1088號6號樓307。公司業(yè)務(wù)分為病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競爭力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識,遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。上海探普生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點(diǎn)競爭力。