牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫(kù)中,牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質(zhì)粒解旋**:將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長(zhǎng)的尾巴會(huì)導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣,在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同,需要靈活運(yùn)用,并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。
Tn5轉(zhuǎn)座酶高通量測(cè)序建庫(kù)、ATAC-seq 等多種先進(jìn)的分子生物學(xué)技術(shù),能夠與這些技術(shù)很好地結(jié)合。Recombinant Mouse P4HB Protein,His Tag
不同的DNA聚合酶在PCR中的應(yīng)用差異主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**TaqDNAPolymerase**:是常用的DNA聚合酶之一,來(lái)源于Thermusaquaticus,具有較高的熱穩(wěn)定性及擴(kuò)增效率。但它缺乏3'-5'核酸外切酶活性,即沒(méi)有校正功能,因此其保真性相對(duì)較低。Taq酶適合擴(kuò)增較短的DNA片段(通常不超過(guò)3kb),且在PCR產(chǎn)物的3'端帶A堿基,可直接用于TA克隆。2.**PfuDNAPolymerase**:來(lái)源于Pyrococcusfuriosus,是一種高保真聚合酶,具有3'-5'外切酶活性,可以修復(fù)并糾正PCR反應(yīng)中的腺嘌呤堿基誤配,有效防止誤差累積。Pfu聚合酶適用于需要高度準(zhǔn)確的PCR擴(kuò)增和DNA測(cè)序。3.**VentDNAPolymerase**:來(lái)源于Thermuslitoralis,具有中等保真度,比Taq聚合酶高兩倍。它適用于GC含量高或復(fù)雜序列的PCR擴(kuò)增,具有較高的熱穩(wěn)定性,半衰期可達(dá)6.7小時(shí)。4.**KODDNAPolymerase**:來(lái)源于Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性是Taq的約50倍,同時(shí)具有合成速度快的特點(diǎn),聚合速度約為普通PfuDNAPolymerase的5倍,特別適合于高保真地?cái)U(kuò)增6kb以?xún)?nèi)的PCR產(chǎn)物。Recombinant Human DKK-1,HisUBE2L3在調(diào)節(jié)NF-κB信號(hào)通路中的作用可能對(duì)免疫反應(yīng)和炎癥過(guò)程至關(guān)重要。
T5核酸外切酶在基因編輯中確實(shí)有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢(shì):1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達(dá)或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達(dá)或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強(qiáng)基因編輯效果**:在另一項(xiàng)研究中,通過(guò)使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱(chēng)為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達(dá)和直接融合,其中強(qiáng)的親和力CC對(duì)顯示出高的突變頻率和刪除長(zhǎng)度。3.**應(yīng)用于多種細(xì)胞類(lèi)型**:CCExo系統(tǒng)在多種細(xì)胞系和原代細(xì)胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血?。–ML)患者的原代細(xì)胞以及異種移植動(dòng)物模型中展示了其應(yīng)用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進(jìn)行融合,并引入了核定位信號(hào)(NLS)序列以構(gòu)建表達(dá)載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強(qiáng)編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時(shí)。
嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)是一種熱穩(wěn)定的酶,它在高溫下(55-65°C)仍然保持活性,這使得它在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中非常有用,尤其是在需要高溫反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)中,如熱循環(huán)擴(kuò)增(PCR)。BstDNAPolymeraseI具有以下特性:1.**熱穩(wěn)定性**:BstDNAPolymeraseI在高溫下具有較高的穩(wěn)定性,適用于高溫反應(yīng)的實(shí)驗(yàn),如PCR。2.**3'到5'外切酶活性**:這種酶具有3'到5'外切酶活性,能夠切除DNA末端上的非特異性引物和雜交DNA,使其成為等溫?cái)U(kuò)增應(yīng)用的理想酶。3.**耐鹽性**:BstDNAPolymeraseI在高鹽條件下仍能保持穩(wěn)定活性,這在一些特殊的PCR應(yīng)用中非常有用。4.**等溫?cái)U(kuò)增**:由于其3'到5'外切酶活性,BstDNAPolymeraseI用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP技術(shù),這種技術(shù)能夠在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增,無(wú)需繁瑣的溫度循環(huán)。5.**快速PCR**:由于其高溫穩(wěn)定性,BstDNAPolymeraseI也可用于快速PCR反應(yīng),縮短了實(shí)驗(yàn)時(shí)間。6.**高GC含量模板擴(kuò)增**:BstDNAPolymeraseI對(duì)高GC含量模板的擴(kuò)增效果較好,因此在一些難擴(kuò)增的模板中表現(xiàn)出色。Uracil-DNA Glycosylase (UDG) 是一種在DNA修復(fù)過(guò)程中起作用的酶,其主要功能是識(shí)別并去除DNA中的尿嘧啶堿基。
T5核酸外切酶在基因克隆中的優(yōu)勢(shì)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**高效性**:T5核酸外切酶依賴(lài)性組裝(TEDA)方法在常規(guī)克隆中的效率與使用專(zhuān)有DNA聚合酶的商業(yè)In-Fusion方法相似,但高于使用T5核酸外切酶、PhusionDNA聚合酶和DNA連接酶的Gibson方法。2.**低成本**:TEDA方法每個(gè)反應(yīng)使用0.04U的T5核酸外切酶,價(jià)格為0.25美分,具有很高的成本效益。3.**簡(jiǎn)單性**:TEDA方法的反應(yīng)混合物非常簡(jiǎn)單,易于操作,這使得它在預(yù)算有限的實(shí)驗(yàn)室中尤其有用。4.**靈活性**:TEDA方法能夠組裝多個(gè)DNA片段,并在多個(gè)位點(diǎn)同時(shí)進(jìn)行定點(diǎn)誘變,提供了一種靈活的克隆和突變方法。5.**陽(yáng)性克隆率**:使用T5核酸外切酶的無(wú)縫克隆技術(shù)可以確保100%的陽(yáng)性克隆率,這提高了實(shí)驗(yàn)的成功率。6.**協(xié)同作用**:在無(wú)縫克隆中,T5核酸外切酶與Phusion高保真DNA聚合酶和TaqDNA連接酶協(xié)同作用,通過(guò)切割、填補(bǔ)和連接三個(gè)步驟,高效地完成DNA片段的連接。7.**減少污染**:T5核酸外切酶可以降解堿裂解提取質(zhì)粒中的變性DNA,減少超螺旋DNA的污染,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。這些優(yōu)勢(shì)使得T5核酸外切酶成為基因克隆中一個(gè)非常有價(jià)值的工具,尤其是在需要高效、低成本和操作簡(jiǎn)便的實(shí)驗(yàn)環(huán)境中。泛素蛋白的C末端通常通過(guò)酰胺鍵與靶蛋白的氨基團(tuán)連接在一起,最常見(jiàn)的是與靶蛋白賴(lài)氨酸的ε氨基團(tuán)相連。Recombinant Human DKK-1,His
中間的催化結(jié)構(gòu)域以及 C 端結(jié)構(gòu)域,這種多結(jié)構(gòu)域的組成使 Tn5 轉(zhuǎn)座酶能精細(xì)地與 DNA 相互作用并發(fā)揮其功能。Recombinant Mouse P4HB Protein,His Tag
耐高鹽全能核酸酶(SaltActiveUltraNuclease)是一種重組非特異性核酸內(nèi)切酶,具有以下特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**來(lái)源與表達(dá)**:耐高鹽全能核酸酶來(lái)源于海洋微生物,通過(guò)基因工程改造在大腸桿菌(_Escherichiacoli_)中表達(dá)純化。2.**活性條件**:在0.5MNaCl條件下具有比較好活性,這使得它在高鹽環(huán)境下也能保持高效。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**病毒純化、疫苗生產(chǎn)**:作為宿主殘留核酸去除試劑,將宿主殘留核酸降至皮克(pg)級(jí)別,提高生物制品功效和安全性。-**蛋白和多糖類(lèi)制藥工業(yè)**:用于去除核酸污染,降低細(xì)胞上清和細(xì)胞裂解液的粘度,提高蛋白純化效率及功能研究。-**防止細(xì)胞結(jié)團(tuán)**:有效防止細(xì)胞和疫苗研究中外周血單核細(xì)胞(PBMC)的結(jié)團(tuán)。4.**產(chǎn)品性質(zhì)**:-分子量:24.7kDa。-等電點(diǎn):9.61。-純度:≥99%。-酶活:250-300U/μL。-適溫度:37℃(工作范圍0-42℃)。-輔助因子:1-10mMMg2+。5.**儲(chǔ)存條件**:以無(wú)菌液體酶的形式提供,儲(chǔ)存于緩沖液(25mMTris-HCl,5mMMgCl2,500mMNaCl,50%Glycerol,pH7.5)中,無(wú)色透明液體。干冰運(yùn)輸,-15℃~-25℃保存,有效期2年。Recombinant Mouse P4HB Protein,His Tag