ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端處理上的主要不同點如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,它從DNA鏈的3'-OH末端逐步切去單核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一種5'→3'核酸外切酶,能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**底物特異性**:-**ExoIII**:適底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于雙鏈DNA切刻位點產(chǎn)生單鏈缺口。由于對單鏈DNA無活性,因此難以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:適底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,對單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低,不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**活性差異**:-**ExoIII**:對具有3'-突出末端(至少有4個堿基,且具有3'-末端C殘基)的DNA、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無活性。-**Lambda核酸外切酶**:對5'-OH端的切割速度比5'-P端慢約20倍;對單鏈DNA的酶切速度比雙鏈DNA慢約100倍。4.**應(yīng)用場景**:-**ExoIII**:可以用于生產(chǎn)特定方向的單鏈DNA,將線性化DNA設(shè)計成為一端為不切割末端(3'突出端),另一端則設(shè)計為易切割末端(平端或5'突出端)。
為了確保PCR實驗中BstDNAPolymeraseI的活性比較大化,以下是一些關(guān)鍵的優(yōu)化措施:1.**反應(yīng)緩沖液**:使用適合BstDNAPolymeraseI的反應(yīng)緩沖液,如NEB提供的IsothermalAmplificationBufferIIPack,該緩沖液包含Tris-HCl、(NH4)2SO4、KCl、MgSO4和Tween®20,pH值為8.8,專為等溫擴增設(shè)計。2.**反應(yīng)條件**:BstDNAPolymeraseI的比較好反應(yīng)溫度通常在65°C左右。確保PCR儀能夠精確控制并保持這一溫度,以保證酶的活性和穩(wěn)定性。3.**酶的濃度**:根據(jù)反應(yīng)體系的需要調(diào)整BstDNAPolymeraseI的用量。過多的酶可能導(dǎo)致非特異性擴增,而過少則可能降低擴增效率。通常,一個單位的酶能夠在65°C下,30分鐘內(nèi)將25nmol的dNTP摻入酸不溶性物質(zhì)。4.**Mg2+濃度**:Mg2+是DNA聚合酶活性的關(guān)鍵輔因子。其濃度對PCR反應(yīng)有影響,需要根據(jù)具體情況調(diào)整Mg2+濃度,以獲得比較好的擴增效果。5.**dNTPs濃度**:dNTPs是DNA合成的基礎(chǔ)原料,其濃度約為200-300μM較為適宜。過高會增加非特異性擴增。6.**引物設(shè)計**:設(shè)計特異性引物,通常長度為18-30個堿基,Tm(熔解溫度)相近,以保證同時退火。7.**模板DNA的質(zhì)量和純度**:確保模板DNA無蛋白質(zhì)、RNA和其他雜質(zhì)的污染,這些雜質(zhì)可能會抑制酶的活性。Recombinant Human CD98 Protein,hFc TagPfu DNA Polymerase在分子進化研究中的應(yīng)用:Pfu DNA Polymerase用于分子進化研究,確保DNA序列的準(zhǔn)確復(fù)制。
磁珠法PCR/DNA純化試劑盒與傳統(tǒng)純化方法相比具有以下優(yōu)勢:1.**操作簡便快捷**:磁珠法純化過程通常可以在15分鐘內(nèi)完成,包括結(jié)合、洗滌和洗脫步驟,無需復(fù)雜的離心或抽濾操作。2.**高純度和高回收率**:磁珠法純化得到的DNA純度高,通常回收率可以達到90%以上,適用于100bp以上的DNA片段的純化,對達到10kb片段DNA的純化也能保持較好的效果。3.**適用性廣**:磁珠法PCR/DNA純化試劑盒適用于多種樣本類型,包括PCR產(chǎn)物、酶切產(chǎn)物、連接產(chǎn)物等,也適用于低濃度樣品的濃縮。4.**安全性高**:操作過程中不涉及酚/氯仿等有毒試劑,更加環(huán)保和安全。5.**靈活性**:可以根據(jù)實際狀況靈活調(diào)節(jié)磁珠用量,適應(yīng)不同體積和濃度的樣品處理。6.**自動化和高通量**:磁珠法純化試劑盒適合手工操作,也可用于自動化工作站或核酸自動提取儀,實現(xiàn)高通量操作。7.**溫和的條件**:磁珠法條件溫和,對DNA的損傷小,適合后續(xù)的多種分子生物學(xué)實驗,如酶切、連接、轉(zhuǎn)化細菌、測序、PCR、雜交等。8.DNA片段適應(yīng)性**:適用于從150bp到50kb的DNA片段的純化,能夠滿足大多數(shù)分子生物學(xué)實驗的需求。
耐高鹽全能核酸酶(SaltActiveUltraNuclease)是一種重組非特異性核酸內(nèi)切酶,具有以下特點和應(yīng)用:1.**來源與表達**:耐高鹽全能核酸酶來源于海洋微生物,通過基因工程改造在大腸桿菌(_Escherichiacoli_)中表達純化。2.**活性條件**:在0.5MNaCl條件下具有比較好活性,這使得它在高鹽環(huán)境下也能保持高效。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**病毒純化、疫苗生產(chǎn)**:作為宿主殘留核酸去除試劑,將宿主殘留核酸降至皮克(pg)級別,提高生物制品功效和安全性。-**蛋白和多糖類制藥工業(yè)**:用于去除核酸污染,降低細胞上清和細胞裂解液的粘度,提高蛋白純化效率及功能研究。-**防止細胞結(jié)團**:有效防止細胞和疫苗研究中外周血單核細胞(PBMC)的結(jié)團。4.**產(chǎn)品性質(zhì)**:-分子量:24.7kDa。-等電點:9.61。-純度:≥99%。-酶活:250-300U/μL。-適溫度:37℃(工作范圍0-42℃)。-輔助因子:1-10mMMg2+。5.**儲存條件**:以無菌液體酶的形式提供,儲存于緩沖液(25mMTris-HCl,5mMMgCl2,500mMNaCl,50%Glycerol,pH7.5)中,無色透明液體。干冰運輸,-15℃~-25℃保存,有效期2年。Endo H 是一種糖蛋白特異性的酶,主要作用于含有 N - 連接寡糖鏈的糖蛋白,對其他類型的生物大分子如核酸。
在PCR產(chǎn)物的克隆中,Lambda核酸外切酶(λExonuclease)有其特定的應(yīng)用和優(yōu)勢,但它不能完全替代其他酶。以下是一些替代酶和它們的特點:1.**ExonucleaseIII(ExoIII)**:-ExoIII具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,尤其適合雙鏈DNA的平末端、5'-突出末端或切口,從DNA鏈的3'-端釋放5'-單磷酸核苷酸,產(chǎn)生單鏈DNA片段。-與Lambda核酸外切酶相比,ExoIII對具有3'-突出末端的DNA有活性,而Lambda核酸外切酶則對5'-磷酸化的雙鏈DNA有更高的活性。2.**TaqDNA聚合酶**:-在平端克隆中,可以使用TaqDNA聚合酶和dATP進行“3'dA加尾”,以提高連接效率。-這種方法通過在PCR產(chǎn)物的3'端添加突出的腺嘌呤(dA),增加了與載體連接的可能性,從而提高克隆效率。3.**TOPO克隆載體**:-TOPO克隆載體含有共價連接的DNA拓撲異構(gòu)酶I,可同時作為限制性內(nèi)切酶和連接酶。-與傳統(tǒng)PCR克隆載體相比,TOPO克隆載體具有更短的連接反應(yīng)時間、更高的克隆效率以及更簡單的分子克隆實驗方案。綜上所述,雖然Lambda核酸外切酶在特定情況下非常有用,但它不能完全替代其他酶。每種酶都有其獨特的特性和應(yīng)用場景,選擇合適的酶取決于具體的克隆需求和實驗設(shè)計。Pfu DNA Polymerase在基因組測序中的應(yīng)用:Pfu DNA Polymerase用于基因組測序,確保測序結(jié)果的準(zhǔn)確性。Smcy HY Peptide (738-746)
泛素分子可以通過其內(nèi)部的賴氨酸殘基與其他泛素分子形成多聚泛素鏈,這一步驟通常由E3酶催化。Recombinant Mouse SLAMF7/CRACC/CD319 Protein,His Tag
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實驗中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點:1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫擴增,如LAMP技術(shù),無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯誤,但保真性相對較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫擴增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴增,包括復(fù)雜模板和長片段的擴增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫擴增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴增。4.**擴增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫擴增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。