蛋白質(zhì)片段互補(bǔ)分析(PCA,也稱為雙分子熒光互補(bǔ))和雙雜交篩選允許檢測細(xì)胞中蛋白質(zhì)相互作用的形成/抑制。PCA將單個檢測蛋白(熒光素酶、GFP、GAL)分成兩部分,這些部分與感興趣的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用融合;如果伴侶結(jié)合,檢測蛋白會重新形成并檢測到信號。高內(nèi)涵成像平臺(HCS)由于其能夠提供出色的單細(xì)胞分析功能和短的數(shù)據(jù)采集時間獲得大家的青睞。一般的實驗流程為設(shè)計實驗并使用自動分液儀將細(xì)胞接種到96、384或1536孔板中;然后加入化合物,由于細(xì)胞在孵育過程中會對化合物做出反應(yīng),隨后對細(xì)胞進(jìn)行染色,并通過HCS成像系統(tǒng)獲取圖像,通過軟件分析獲取的圖像以確定化合物的劑量反應(yīng)。高內(nèi)涵高通量篩選系統(tǒng)。寧夏高通量篩選小分子庫
高通量篩選技術(shù),是目前藥物篩選領(lǐng)域研究的重要課題,近年來,對它的研究應(yīng)用雖然已取得了長足的發(fā)展,但仍然存在許多難題,如體外模型的篩選結(jié)果與整體藥理作用的關(guān)系;對高通量篩選模型的評價標(biāo)準(zhǔn)以及新的藥物作用靶點的研究和發(fā)現(xiàn)等。隨著醫(yī)藥學(xué)的進(jìn)步,高通量篩選技術(shù)在創(chuàng)新藥物的研發(fā)中,一定會開拓出更廣闊的空間。我國進(jìn)行藥物高通量篩選的優(yōu)勢首先是化合物來源,且多為天然;其次是對化合物生物活性的篩選目的較明確,無目的合成的化合物較少;第三,我國傳統(tǒng)藥物為篩選研究提供了一個巨大的資源庫,可從中藥中提取分離篩選新的化合物。這些優(yōu)勢為藥物的高通量篩選打下了堅實基礎(chǔ)。北京高通量篩選技術(shù)命中率高通量篩選技術(shù)的靶點是。
時間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)原理為具有長壽命熒光(通常為100秒的毫秒至毫秒)的鑭系配合物用作FRET供體,熒光蛋白或有機(jī)熒光團(tuán)(例如,別藻藍(lán)素或Cy5)用作受體。普通熒光的半衰期為納秒級,鑭系元素的半衰期為毫秒級,有6個數(shù)量級的差別。所以在檢測時,TR-FRET有一個時間延遲~100微秒,從而使反應(yīng)體系內(nèi)普通背景熒光信號消耗掉,因此TR-FRET的背景信號非常低,能夠反映樣品實際情況?;诩?xì)胞水平的篩選的關(guān)鍵特征之一是可以一次篩選多個靶標(biāo)?;诩?xì)胞的篩選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標(biāo)未知,2)靶標(biāo)無法在生化測定中充分重組,3)所需的表型只存在于細(xì)胞環(huán)境中,例如從一種細(xì)胞類型分化到另一種細(xì)胞類型?;诩?xì)胞的檢測貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標(biāo)選擇和驗證、初步篩選、先導(dǎo)化合物識別、先導(dǎo)化合物優(yōu)化以及安全和毒理學(xué)篩選。介紹一些細(xì)胞水平分析的方法:細(xì)胞活力、報告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。
然而傳統(tǒng)的針對單一靶點的研究方法已經(jīng)難以適應(yīng)一些多基因疾病和病毒等相關(guān)藥物的研究。而基于細(xì)胞水平的高內(nèi)涵篩選(high content screening, HCS)技術(shù)實現(xiàn)了對化合物多靶點多參數(shù)的同時檢測,從疾病相關(guān)基因調(diào)控通路和網(wǎng)絡(luò)水平上研究藥物的作用機(jī)制、代謝途徑和潛在毒性等,也使在細(xì)胞水平評價活性化合物的成成為可能。從篩選載體上看,HCS和HTS并沒有的區(qū)別,它的檢測體積并未因檢測指標(biāo)增加而增高,操作步驟同樣簡單可行、可自動化。故HCS在新藥研發(fā)中發(fā)揮越來越重要的作用。細(xì)胞高通量篩選技術(shù)。
高通量篩選的特色效用高通量篩選技術(shù)是將多種技術(shù)方法有機(jī)結(jié)合而形成的一種新技術(shù)體系,它以微板形式作為實驗工具載體,以自動化操作系統(tǒng)執(zhí)行實驗過程,以靈敏快速的檢測儀器采集實驗數(shù)據(jù),以計算機(jī)對數(shù)以千計的樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,從而得出科學(xué)準(zhǔn)確的實驗結(jié)果和特色效用。英國學(xué)者AlanD研究提示,一個實驗室采用傳統(tǒng)的方法,借助20余種藥物作用靶位,1年內(nèi)能篩選75000個樣品;1997年高通量篩選技術(shù)發(fā)展初期,采用100余種靶位,每年可篩選100萬個樣品;1999年高通量篩選技術(shù)進(jìn)一步完善后,每天的篩選量就高達(dá)10萬種化合物。近年來,光學(xué)測定技術(shù)在美、英兩國研究人員在高通量篩選檢測中,努力進(jìn)行了光學(xué)測定方法的研究,建立了大量的非同位素標(biāo)記測定法,如用分光光度檢測法篩選蛋白酪氨酸激酶抑制劑、組織纖溶酶原劑等,均獲得成功。高通量篩選方法有哪些。寧夏高通量篩選小分子庫
組合化學(xué)高通量篩選。寧夏高通量篩選小分子庫
正如之前提到,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,用于衡量酶活性多的當(dāng)屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進(jìn)行匹配。但是這兩種檢出方法也有不適用的場景,比如吸光度檢出法,在終點法測定(endpointassay)時,如果化合物庫的吸收低于~410nm,實驗的背景吸收會引入假陽性(false-positive)和假陰性(false-negative)結(jié)果。雖然假陽性結(jié)果可以通過動力學(xué)Assay或者驗證Assay來解決,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強(qiáng)吸收,所以仍舊會導(dǎo)致Z因子降低,直接結(jié)果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來。而對于熒光檢出法而言,自發(fā)熒光化合物庫或者具有光敏特性的化合物庫同樣會遇到假陽性和假陰性結(jié)果。在某種程度上,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問題,比如使用更長波段的光源,對于熒光檢出來說,>500nm會是比較好的選擇。寧夏高通量篩選小分子庫