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蘇州臻準(zhǔn)數(shù)字PCR分析應(yīng)用

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-27

根據(jù)泊松分布的定義和適用條件可知,如果我們?cè)O(shè)微液滴總數(shù)為N,投入的靶序列拷貝數(shù)為M,那么“每個(gè)微液滴中的靶序列拷貝數(shù)”的概率分布是近似滿足泊松分布的。理解之前,首先要明確一點(diǎn),在檢測(cè)的過(guò)程中,并不是說(shuō)一個(gè)樣本中檢測(cè)到了幾個(gè)亮點(diǎn),這個(gè)反應(yīng)當(dāng)中就有幾個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因?yàn)槟繕?biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說(shuō)進(jìn)不進(jìn)的概率相等,并且相互獨(dú)立)。所以,一個(gè)發(fā)光的微滴中,可能有一個(gè)或者三個(gè)四個(gè),甚至更多個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對(duì)一的對(duì)應(yīng)關(guān)系。目前dPCR中體積優(yōu)化方法以光學(xué)顯微鏡觀測(cè)為主。蘇州臻準(zhǔn)數(shù)字PCR分析應(yīng)用

引物設(shè)計(jì)(DesignPrimers):引物長(zhǎng)度(PrimerLength):18-25個(gè)堿基之間。短的引物更易于同靶序列結(jié)合,但過(guò)短的引物也更可能同基因組上的多個(gè)區(qū)域相結(jié)合而產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。更長(zhǎng)的引物會(huì)提高同靶序列結(jié)合的特異性,但過(guò)長(zhǎng)的引物(>30bp)同靶序列結(jié)合速度變慢,降低結(jié)合率。引物長(zhǎng)度和組成直接影響引物Tm值(PrimerMeltingTemperature)和退火溫度(AnnealingTemperatures)。引物的組成——GC%含量(GCContent):指引物總堿基中G和C堿基數(shù)量的百分比,該值應(yīng)在40-60%之間。如果模板序列的GC含量較高,推薦使用較高Tm值的引物。廣東銳訊數(shù)字PCR儀器dPCR被稱作第三代PCR技術(shù),但dPCR技術(shù)的廣泛應(yīng)用逐漸顯現(xiàn)出一些不足之處。

基于微滴的QX100dPCR儀,利用油包水技術(shù),將樣品平均分配到20000個(gè)微滴油包水中,利用微滴分析儀對(duì)微滴進(jìn)行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR儀,在高壓氣體驅(qū)動(dòng)下,將每個(gè)標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系分割成包含100萬(wàn)至1000萬(wàn)個(gè)皮升級(jí)別微滴的反應(yīng)乳液。數(shù)字PCR就形成了2大派別,芯片式和微滴式。不論是哪種數(shù)字PCR,其原理都是有限稀釋,終點(diǎn)PCR和泊松分布。將含有核酸模板的標(biāo)準(zhǔn)PCR反應(yīng)體系,平均分配成幾萬(wàn)個(gè)PCR反應(yīng),分配到芯片或微滴中,使每個(gè)反應(yīng)中盡可能含有一個(gè)模板分子,進(jìn)行單分子模板PCR反應(yīng),通過(guò)讀取熒光信號(hào)的有或無(wú)進(jìn)行計(jì)數(shù),經(jīng)過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)泊松分布的校準(zhǔn)進(jìn)行定量。

本次推出的全自動(dòng)數(shù)字PCR一體機(jī)可以適用于包括醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域在內(nèi)的多種應(yīng)用場(chǎng)景。對(duì)于可以實(shí)現(xiàn)早期篩查、早期診斷、用藥指導(dǎo)以及監(jiān)測(cè)的復(fù)發(fā)。對(duì)于病原體可以實(shí)現(xiàn)超多重檢測(cè),以利于快速診斷。在優(yōu)生優(yōu)育領(lǐng)域也可以實(shí)現(xiàn)更多遺傳性疾病的診斷和檢測(cè)。對(duì)于臨床應(yīng)用具有極大的潛力和價(jià)值。通過(guò)線上+線下的方式舉行了數(shù)字PCR2.0技術(shù)方案研討會(huì),來(lái)自醫(yī)療界的**學(xué)者共聚一堂,圍繞PCR技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用進(jìn)行交流和討論。歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。數(shù)字PCR是直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),是對(duì)起始樣品的定量。

無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查有望成為數(shù)字PCR在臨床快速落地的锏應(yīng)用。首先,無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查領(lǐng)域?qū)τ诩骖櫝杀?、?zhǔn)確性、速度的創(chuàng)新技術(shù)的需求還未滿足。其次,無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查市場(chǎng)空間龐大,雖說(shuō)中國(guó)每年新生兒的增長(zhǎng)速度正在放緩,但每年仍有超過(guò)1000萬(wàn)的新生兒,帶來(lái)了巨大的想象空間。2022年6月,鄭大一附院遺傳與產(chǎn)前診斷中心、塔歌生物聯(lián)合在JournalofTranslationalMedicine(影響因子5.531)雜志上發(fā)表文章,驗(yàn)證了數(shù)字PCR作為T(mén)21,T18和T13產(chǎn)前篩查方法的可行性,這是世界上報(bào)道在真實(shí)臨床條件下通過(guò)盲檢實(shí)現(xiàn)一管反應(yīng)可從孕婦血漿樣本中同時(shí)檢測(cè)出T21、T18和T13的數(shù)字PCR無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查試劑盒。文章顯示,塔歌生物胎兒染色體非整倍體無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查數(shù)字PCR試劑盒總體篩查的靈敏度為100%,特異性為95.12%,均優(yōu)于血清學(xué)篩查。除準(zhǔn)確率高之外,塔歌生物的產(chǎn)品還擁有成本低、操作簡(jiǎn)便,及檢測(cè)速度快等優(yōu)勢(shì),可以加速無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查在各級(jí)醫(yī)院,特別是基層地區(qū)普遍落地,助力中國(guó)出生缺陷防控。在數(shù)字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查注冊(cè)證的申報(bào)。一體化數(shù)字PCR原理

3D數(shù)字PCR是基于納米流體芯片進(jìn)行檢測(cè),通過(guò)一次檢測(cè),將樣品分到數(shù)千個(gè)單獨(dú)的PCR。蘇州臻準(zhǔn)數(shù)字PCR分析應(yīng)用

數(shù)字PCR產(chǎn)品的發(fā)展,為不同場(chǎng)景下的多樣化核酸檢測(cè)需求提供了新的思路,尤其是在醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)方面,在 性疾病早期檢測(cè)、病癥的液體活檢、無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢查等領(lǐng)域展現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景。實(shí)現(xiàn) 性疾病早期高效檢測(cè)——以病毒為例,有病毒檢測(cè)、和臨床樣本病毒載量評(píng)估He監(jiān)測(cè)環(huán)境病毒載量;二代熒光定量PCR檢測(cè)技術(shù)是目前病毒檢測(cè)的"金標(biāo)準(zhǔn)",但由于病毒探針結(jié)合位點(diǎn)突變、樣本病毒載量不足等原因,在臨床檢測(cè)過(guò)程中經(jīng)常出現(xiàn)假陰性結(jié)果,由于數(shù)字PCR具有更高的靈敏度、精細(xì)度,以及其適合痕量樣本檢測(cè)的特性,能夠檢測(cè)出熒光定量PCR檢測(cè)過(guò)程中錯(cuò)過(guò)的 ,可作為后者的補(bǔ)充。在人群篩查及臨床診療中,為科學(xué)選取采樣方式,需要評(píng)估不同臨床樣本病毒載量,如鼻咽拭子、血尿、糞便、肺泡灌洗液等,由于數(shù)字PCR可提供一定程度上量化指標(biāo),為采樣方法的選取提供了參考,從而提高檢出率。在外防輸入的戰(zhàn)略要求下,環(huán)境病毒檢測(cè)工作尤為重要,數(shù)字PCR可對(duì)低核酸豐度樣本進(jìn)行有效檢測(cè),包括從不同環(huán)境中取樣的樣本,如病房、醫(yī)院衛(wèi)生間、實(shí)驗(yàn)室等等,在病情防控中起到了不可忽視的作用。此外,數(shù)字PCR的應(yīng)用場(chǎng)景還有病程不同階段的病毒載量評(píng)估、核酸參考品制備、抗病毒藥物研發(fā)等環(huán)節(jié)。蘇州臻準(zhǔn)數(shù)字PCR分析應(yīng)用

廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司屬于精細(xì)化學(xué)品的高新企業(yè),技術(shù)力量雄厚。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè)。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,致力于提供高質(zhì)量的數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀。雙螺旋科學(xué)儀器以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。