從作物的根際土壤、根表、植株及葉片上分離篩選出的枯草芽孢桿菌菌株對不同作物的眾多真類菌和細菌病害具有拮抗作用。如糧食作物中的水稻紋枯病、稻瘟病,小麥紋枯病,豆類根腐病等;蔬菜病害中的番茄葉病、枯萎病,黃瓜枯萎病菌、霜霉病,茄子灰霉病和辣椒疫病等??莶菅挎邨U菌還可以控制采后水果的多種病害,如蘋果霉心病,柑橘青霉病,油桃褐腐病,草莓灰霉病和香蕉枯萎病、冠腐病、炭疽病,蘋果及梨青霉病、黑斑病、潰瘍病,金花梨果腐病等。此外,枯草芽孢桿菌對楊樹潰瘍病、腐爛病、樹黑斑病及炭疽病,茶輪斑病,炭疽病、黑脛病、赤星病菌、根腐病,棉花立枯病、枯萎病等也有較好的防治作用。金黃色葡萄球是抑菌物質(zhì)中毒和一般營養(yǎng)不良時成為次級的微生物區(qū)系的主要細菌。震顫厄氏菌菌株
大腸桿菌屬的系統(tǒng)發(fā)育:大量屬于該物種的菌株已得到分離和鑒定。除了血清型(videsupra),它們還可以根據(jù)它們的系統(tǒng)發(fā)育(即推斷的進化史)進行分類。如下所示,其中該物種分為六組。特別是全基因組序列的使用產(chǎn)生了高度支持的系統(tǒng)發(fā)育。基于這些數(shù)據(jù),大腸桿菌的5個亞種被區(qū)分開來。系統(tǒng)發(fā)育距離(“關(guān)聯(lián)性”)和病理學之間的聯(lián)系很小,例如O157:H7血清型菌株形成一個分支(“一個獨特的群”)—下面的E群——都是腸出血性菌株(EHEC),但并不是所有的EHEC菌株都是密切相關(guān)的。事實上,四種不同的志賀氏菌嵌套在大腸桿菌菌株(見上),然而E.albertii和E.fergusonii不屬于這個群體。事實上,在包括類型菌株在內(nèi)的系統(tǒng)基因組研究中,所有志賀菌都被放在大腸桿菌的一個亞種內(nèi),因此很難進行相應的重新分類。所有常用的研究菌株大腸桿菌屬于a組,主要來源于Clifton的K-12菌株(λ?f?。O16)并且在較小程度上來自d'Herelle的大腸桿菌菌株(B菌株)(O7)。斯瓦特貝赫山克里布所菌枯草芽孢桿菌定殖、繁殖速度更快。
銅綠假單胞菌低溫保存法主要為簡單保存法,將瓊脂斜面孢子培養(yǎng)物、菌絲懸浮液以及由麩皮、大米、小米等谷物原料制成的孢子培養(yǎng)物置于4攝氏度冰箱保存,保存時間不超過1~2個月,若將谷物原料制備的孢子瓶抽真空并在棉塞上浸蠟,以隔絕外界空氣和水汽,保持時間可達3~4個月。液氮較低溫保存法,將生長穩(wěn)定期的細胞懸浮在10%甘油或其他低冰點液體中,密封于安瓿管內(nèi),然后控制冷卻速度,使安瓿管溫度逐步下降至-35攝氏度時,即可置于-150~-196攝氏度的液氮罐中保存。大多數(shù)微生物如病毒、噬菌體、多種細菌、放線菌、酵母和原蟲、特別是一些用冷凍干燥法有困難的微生物,都可用此法長期保存。
有些銅綠假單胞桿菌的保藏方法,如濾紙保藏法、液氮保藏法和冷凍干燥保藏法等均需使用保護劑來制備細胞懸液,以防止因冷凍或水分不斷升華對細胞的損害。保護性溶質(zhì)可通過氫和離子鍵對水和細胞所產(chǎn)生的親和力來穩(wěn)定細胞成分的構(gòu)型。保護劑有牛乳、血清、糖類、甘油、二甲亞砜等。銅綠假單胞桿菌的多聚酶鏈式反應基本原理類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性、退火、延伸三個基本反應步驟構(gòu)成模板DNA經(jīng)加熱至93攝氏度左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備。不同的大腸桿菌有不同的培養(yǎng)原理。
SHBCCD24508高加索酸奶乳桿菌SHBCCD24509瑞士乳桿菌SHBCCD24510乳桿菌屬SHBCCD24511類干酪乳桿菌SHBCCD24512類干酪乳桿菌SHBCCD24513瑞士乳桿菌SHBCCD24514乳桿菌屬SHBCCD24515乳桿菌屬SHBCCD24516鏈球菌屬SHBCCD24517發(fā)酵乳桿菌SHBCCD24518類干酪乳桿菌SHBCCD24519發(fā)酵乳桿菌SHBCCD24520德氏乳桿菌SHBCCD24521鏈球菌屬SHBCCD24522戊糖乳桿菌SHBCCD24523片球菌屬SHBCCD24524戊糖乳桿菌SHBCCD24525消化乳桿菌SHBCCD24526瑞士乳桿菌SHBCCD24527產(chǎn)馬乳酒乳桿菌SHBCCD24528產(chǎn)馬乳酒乳桿菌SHBCCD24529乳桿菌屬SHBCCD24530德氏乳桿菌SHBCCD24531發(fā)酵乳桿菌SHBCCD24532乳球菌屬SHBCCD24533乳球菌屬SHBCCD24534鏈球菌屬SHBCCD24535戊糖乳桿菌SHBCCD24536乳桿菌屬SHBCCD24537類干酪乳桿菌SHBCCD24538醋化醋桿菌奧爾蘭亞種SHBCCD24539巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24540巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24541巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24542巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24543巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24544巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24545巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24546巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24547巴氏醋桿菌巴氏亞種SHBCCD24548巴氏醋桿菌羅旺亞種SHBCCD24549巴氏醋桿菌羅旺亞種 銅綠假單胞菌普遍存在于假單胞菌屬的其他細菌以及肺炎桿菌、大腸桿菌、霍亂弧菌等g-細菌中。產(chǎn)黑色鏈霉菌菌株
大腸桿菌的發(fā)生與流行傳染是呈世界性分布的。震顫厄氏菌菌株
大腸桿菌包括大量的細菌群體,它們表現(xiàn)出高度的遺傳和表型多樣性。對大量分離的大腸桿菌和相關(guān)細菌進行基因組測序表明,需要對其進行分類重組。然而,這并沒有做到,主要是因為它在醫(yī)學上的重要性以及大腸桿菌仍然是至多樣化的細菌物種之一:在一個典型的大腸桿菌基因組中,只有20%的基因在所有菌株之間共享。事實上,從進化的角度來看,志賀氏桿菌屬的成員(痢疾志賀菌,福氏志賀菌,鮑氏志賀菌和宋內(nèi)志賀菌)應該被歸類為大腸桿菌菌株,這一現(xiàn)象被稱為偽裝的分類群。同樣,大腸桿菌的其他菌株(如重組DNA工作中常用的K-12菌株)也有足夠的不同,因此需要重新分類。震顫厄氏菌菌株
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