免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation,簡稱IP)是一種生物化學(xué)方法,它利用特異性抗體對抗原進(jìn)行親和純化。在含有目的抗原的細(xì)胞裂解液中加入特定的抗體以及Protein A/G-Beads(預(yù)先將Protein A/G固定結(jié)合在磁珠上),根據(jù)抗原與抗體、Protein A/G與抗體的Fc的特異性,形成“抗原-抗體-Protein A/G-Beads”復(fù)合物,清洗離心后去除溶液中未結(jié)合的雜蛋白,檢測是否存在目的蛋白。
免疫沉淀技術(shù)常用于從細(xì)胞或組織裂解物中分離用于免疫印跡檢測或其他檢測技術(shù)的蛋白和其他生物分子。它的目標(biāo)是分離足夠用于Western Blot或其他檢測方法檢測的蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術(shù)IP的原理是什么?上海Protein AG免疫沉淀磁珠原理
Co-IP(免疫共沉淀)技術(shù)主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,其實驗設(shè)計如下:
1. 樣品準(zhǔn)備:Co-IP實驗通常有兩種,一種是內(nèi)源性蛋白相互作用驗證,一種是非內(nèi)源性蛋白相互作用驗證。內(nèi)源性相互作用通過質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染的方式將兩種蛋白轉(zhuǎn)染至同一細(xì)胞內(nèi)表達(dá);非內(nèi)源性相互作用則是將含有靶蛋白的組織進(jìn)行預(yù)處理及細(xì)胞裂解獲得細(xì)胞裂解液。
2. 沉淀誘餌蛋白:利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白。在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體,抗體會與誘餌蛋白結(jié)合,利用磁鐵將磁珠拉下,同時誘餌蛋白會一起被沉淀出來。
3. SDS-PAGE及WB檢測:得到沉淀后,需要驗證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復(fù)合物分離,隨后利用WB檢測是否存在靶蛋白。
4. 實驗對照設(shè)置:為了避免“假陽性”,需要設(shè)置正確的對照,包括陰性對照和陽性對照(Input組)。Input組為直接利用抗體對細(xì)胞裂解液進(jìn)行WB檢測,驗證細(xì)胞裂解液中存在蛋白。
5. 結(jié)果真實性:確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的,而并非外源非特異蛋白。使用單克隆抗體有助于避免污染的發(fā)生。
ChIP免疫沉淀磁珠的選擇免疫沉淀的原理是什么?
免疫沉淀技術(shù)的實驗方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準(zhǔn)備
2. 細(xì)胞裂解:使用裂解緩沖液(含有蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解)裂解細(xì)胞,釋放蛋白質(zhì)。
3. 蛋白質(zhì)濃度測定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。
4. 抗體預(yù)處理:如果使用預(yù)固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反應(yīng):將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)充分結(jié)合。
6. 固相支持物的回收:對于未固定的抗體,加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物。
7. 洗滌:去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì),通常需要多次洗滌固相支持物。
8. 洗脫:使用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復(fù)合物。
9. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質(zhì)譜分析等,以進(jìn)一步分析目標(biāo)蛋白質(zhì)。
10. 對照實驗:包括正對照(已知能沉淀目標(biāo)蛋白的抗體)和負(fù)對照(非特異性抗體或無抗體)以驗證實驗的特異性。
免疫共沉淀分析(Co-IP)與IP十分類似,基本的技術(shù)都是采用目標(biāo)抗原特異性的固相化抗體;但I(xiàn)P的目標(biāo)是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。
在Co-IP實驗中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強(qiáng)度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間。
基本的Co-IP實驗方案與IP相同,實際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時,需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強(qiáng)度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
免疫沉淀技術(shù)IP的應(yīng)用有哪些?
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實驗步驟通常包括以下幾個關(guān)鍵環(huán)節(jié):
1. 細(xì)胞裂解:首先需要收集細(xì)胞并裂解它們,以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。這通常通過添加含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液來完成,以防止蛋白質(zhì)降解。
2. 裂解物上清:裂解后的細(xì)胞混合物通常需要通過離心來去除未破碎的細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞,從而獲得上清。
3. 抗體的添加:將特定于目標(biāo)蛋白的抗體加入到裂解物中。這些抗體將特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白上。
4. 免疫復(fù)合物的形成:抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合形成免疫復(fù)合物。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲:使用Protein A/G結(jié)合的磁珠來捕獲免疫復(fù)合物。
6. 洗滌:捕獲免疫復(fù)合物后,需要用裂解/洗滌緩沖液多次洗滌,以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他污染物。
7. 洗脫:免疫復(fù)合物可以通過加入SDS樣品緩沖液進(jìn)行洗脫,這將導(dǎo)致抗體和抗原變性并從珠子上釋放下來,或者使用低pH緩沖液進(jìn)行溫和洗脫,以保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象。
8. 分析:洗脫后的樣品可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot等方法進(jìn)行分析,以驗證目標(biāo)蛋白的存在和狀態(tài)。
免疫沉淀技術(shù)RIP是什么?
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免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用和蛋白質(zhì)特性的重要方法。它具有一些明顯的優(yōu)點,但也存在一些局限性。
優(yōu)點:
1. 特異性強(qiáng):IP技術(shù)利用特異性抗體對目標(biāo)蛋白進(jìn)行捕獲,因此具有很高的特異性。
2. 富集低豐度蛋白:可以從小量樣本中富集低豐度的目標(biāo)蛋白,有助于研究稀有蛋白。
3. 研究蛋白質(zhì)相互作用:通過Co-IP等變體技術(shù),可以研究蛋白質(zhì)之間的相互作用。
4. 操作簡便:IP實驗步驟相對簡單,容易在實驗室中實施。
缺點:
1. 對抗體質(zhì)量依賴性高:需要高質(zhì)量的特異性抗體,否則可能導(dǎo)致假陽性或?qū)嶒炇 ?
2. 存在非特異性結(jié)合:樣本中的其他蛋白質(zhì)可能非特異性地結(jié)合到抗體或固相載體上。
3. 可能破壞蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象:裂解和洗滌步驟可能破壞蛋白質(zhì)的天然結(jié)構(gòu),影響其功能。
4. 可能存在背景噪聲:非特異性結(jié)合可能導(dǎo)致背景噪聲,影響結(jié)果的清晰度和解釋。
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