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來源： 發(fā)布時間：2024-06-18

免疫沉淀技術(shù)（Immunoprecipitation, IP）是一種利用抗體與特定蛋白質(zhì)結(jié)合的特性，從復雜樣本中分離和純化目標蛋白質(zhì)的實驗方法。這項技術(shù)在生物醫(yī)學研究中有著廣泛的應(yīng)用場景，以下是一些主要的應(yīng)用領(lǐng)域：
1. 蛋白質(zhì)相互作用分析：通過免疫沉淀技術(shù)，研究人員可以研究蛋白質(zhì)之間的相互作用，揭示蛋白質(zhì)復合物的組成以及它們在細胞內(nèi)的功能和調(diào)控機制。
2. 抗體藥物開發(fā)：免疫沉淀技術(shù)可以用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結(jié)合特性，評估抗體藥物的親和力和特異性，指導抗體藥物的設(shè)計和優(yōu)化。
3. 蛋白質(zhì)表達水平分析：通過比較不同條件下的免疫沉淀結(jié)果，可以評估目標蛋白的相對量，進而研究蛋白質(zhì)的表達調(diào)控。
4. 染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）：這是一種特殊的免疫沉淀技術(shù)，用于研究蛋白質(zhì)與DNA的相互作用，如轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾與基因組特定區(qū)域的結(jié)合情況。
5. RNA免疫沉淀（RIP）：類似于ChIP，RIP用于研究RNA結(jié)合蛋白與RNA分子之間的相互作用。
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ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實驗是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實驗的實驗方法概述：
1. 交聯(lián)：將細胞與交聯(lián)劑（如1%甲醛）孵育，通常在室溫下進行10-15分鐘。
2. 終止交聯(lián)：添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應(yīng)，孵育5分鐘。
3. 收集細胞：通過離心收集細胞，并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑。
4. 細胞裂解：使用裂解緩沖液裂解細胞，釋放染色質(zhì)。
5. 染色質(zhì)剪切：使用超聲波或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當大小的片段。
6. 免疫沉淀：將剪切后的染色質(zhì)與特異性抗體孵育，然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗滌：用低鹽、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠，去除非特異性結(jié)合物。
8. 洗脫：用洗脫緩沖液洗脫DNA。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián)：用蛋白酶K處理，然后在65°C下加熱過夜以逆轉(zhuǎn)交聯(lián)。
10. DNA純化：使用商業(yè)試劑盒或標準酚/氯仿方法純化DNA。
11. 分析：使用qPCR分析富集的DNA，或進行測序以確定蛋白質(zhì)結(jié)合位點。
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免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因：
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低，則有幾種方法可以進行優(yōu)化。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分。使用普通微珠預純化樣本還可以降低非目標分子的共純化。此外，還可以使用無關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實驗中會出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會影響下游分析，則需要使用抗體通過共價連接固定至微珠的方法進行實驗，如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。

免疫沉淀IP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu)，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸，具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ，盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強，而磁珠在得率，可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀技術(shù)IP的優(yōu)缺點是什么？

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RNA免疫沉淀技術(shù)（RIP）是一種研究RNA與蛋白質(zhì)相互作用的重要方法，其應(yīng)用領(lǐng)域主要包括：
1. 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控研究：RIP技術(shù)可以幫助研究者了解RNA在轉(zhuǎn)錄后水平如何被調(diào)控。
2. 表觀遺傳調(diào)控：RIP技術(shù)用于研究RNA結(jié)合蛋白（RBPs）在表觀遺傳調(diào)控中的作用。
3. 非編碼RNA功能研究：RIP技術(shù)可以用來研究長非編碼RNA（lncRNA）、miRNA和其他小RNA的種類，以及它們?nèi)绾闻c蛋白質(zhì)相互作用來調(diào)控基因表達。
4. RNA病毒研究：RIP技術(shù)也可用于研究RNA病毒與其宿主細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的相互作用，進而了解病毒復制和致病機制。
5. RNA修飾和甲基化研究：RIP技術(shù)結(jié)合其他技術(shù)如m5C-RIP-seq，可用于研究RNA甲基化修飾及其在病理過程中的作用。
6. RNA定位和穩(wěn)定性：通過RIP技術(shù)，研究者可以探索特定RNA在細胞內(nèi)的定位以及它們?nèi)绾伪环€(wěn)定或降解。
7. RNA-蛋白質(zhì)復合物的鑒定：RIP技術(shù)可以用來鑒定與特定RNA結(jié)合的蛋白質(zhì)，從而揭示RNA-蛋白質(zhì)復合物的組成。
8. 疾病相關(guān)RNA研究：RIP技術(shù)在疾病相關(guān)RNA的研究中也有應(yīng)用。
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免疫沉淀技術(shù)的實驗方法。上海蛋白免疫沉淀外包公司

Co-IP（Co-Immunoprecipitation，共免疫沉淀）的實驗方法通常包括以下步驟：
1. 細胞培養(yǎng)與裂解：細胞在適宜的培養(yǎng)條件下生長到適當?shù)拿芏取?/span>
蛋白質(zhì)分離：裂解后的細胞混合物通過離心去除未破碎的細胞碎片和未裂解的細胞。收集上清液
2. 抗體的添加：將特異性抗體（針對目標蛋白質(zhì)的抗體）加入到裂解物中。
3. 免疫復合物的形成：抗體與目標蛋白結(jié)合后，形成免疫復合物。
4. 親和介質(zhì)的使用：向混合物中添加蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）。
5. 免疫復合物的捕獲：將混合物與珠子孵育一段時間后，使用磁鐵或離心的方法將珠子收集起來，同時捕獲了與之結(jié)合的免疫復合物。
6. 洗滌：洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他分子。
7. 洗脫：使用適當?shù)木彌_液將免疫復合物從珠子上洗脫下來，常用的緩沖液包括SDS樣品緩沖液，用于后續(xù)的電泳分析。
8. 蛋白質(zhì)分析：洗脫的蛋白質(zhì)可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot、質(zhì)譜分析等方法進行進一步分析。
9. 實驗對照：實驗中應(yīng)包括陽性對照和陰性對照，以確保實驗結(jié)果的可靠性。
10. 數(shù)據(jù)分析：對實驗結(jié)果進行分析，確認目標蛋白是否成功沉淀，并鑒定任何可能的相互作用蛋白。
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