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關(guān)于二代測(cè)序的簡介:
二代測(cè)序技術(shù)(Next-Generation Seguencing,NGS)也稱為高通量測(cè)序技術(shù),是一種能夠同時(shí)對(duì)數(shù)百萬甚至數(shù)十億個(gè) DNA片段進(jìn)行測(cè)序的方法。與傳統(tǒng)的桑格測(cè)序相比二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、高準(zhǔn)確性、高靈敏度和低成本等優(yōu)勢(shì)。
二代測(cè)序技術(shù)在大幅提高了測(cè)序速度的同時(shí),大幅度的降低了測(cè)序成本,保持了高準(zhǔn)確性,以前完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間,而使用二代測(cè)序技術(shù)則需要1周,但其序列讀長方面比起一代測(cè)序技術(shù)則要短很多,大多只100bp-150bp。
二代測(cè)序需要分析嗎?云南嘉安健達(dá)二代測(cè)序運(yùn)用
宏基因組二代測(cè)序,你了解多少?
宏基因組二代測(cè)序(mNGS)是一項(xiàng)覆蓋病原譜廣且高通量的檢測(cè)技術(shù),已在臨床領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。對(duì)于血液病患者,病原mNGS通過對(duì)樣本快速高通量測(cè)序,可以獲得更準(zhǔn)確、相對(duì)無偏倚的病原信息,對(duì)病原診斷起到積極的作用,尤其對(duì)傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測(cè)未覆蓋到或檢測(cè)周期較長、陽性率較低的病原可提高檢出率。對(duì)于臨床相關(guān)樣本應(yīng)首先完善傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測(cè),病理、無菌標(biāo)本培養(yǎng)仍然是診斷的金標(biāo)準(zhǔn),病原mNGS是對(duì)傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測(cè)的有力補(bǔ)充和延展而非替代。病原mNGS的報(bào)告解讀應(yīng)充分評(píng)估檢出微生物的致病性、流行病學(xué)、生物信息學(xué)信息,同時(shí)在結(jié)合患者臨床特征的基礎(chǔ)上進(jìn)行綜合判斷。 黑龍江哪里有二代測(cè)序分析二代測(cè)序的工作原理是什么?
二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異①
**患者
優(yōu)勢(shì):對(duì)于**患者,二代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性相對(duì)較高,在**的診斷、***及監(jiān)測(cè)等方面應(yīng)用***。比如肺*患者,通過檢測(cè)**組織或血液中的基因突變,可準(zhǔn)確找到如EGFR、ALK等驅(qū)動(dòng)基因突變,為靶向***提供依據(jù),其準(zhǔn)確率通常在90%以上。在軟組織**中,二代測(cè)序能檢測(cè)到**組織的基因信息,包括突變基因、基因表達(dá)情況等,幫助醫(yī)生更準(zhǔn)確地診斷病情,并制定個(gè)性化的***方案。
局限性:腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性會(huì)影響檢測(cè)準(zhǔn)確性,若樣本中腫瘤細(xì)胞比例低或存在多種類型細(xì)胞,可能導(dǎo)致部分基因突變漏檢,影響對(duì)**基因組全貌的評(píng)估。此外,血液樣本中循環(huán)**DNA含量低且釋放不穩(wěn)定,也會(huì)使檢測(cè)結(jié)果存在波動(dòng),影響準(zhǔn)確性
二代測(cè)序的建庫步驟④
四、接頭連接
接頭選擇:根據(jù)測(cè)序平臺(tái)的要求選擇合適的接頭。不同的二代測(cè)序平臺(tái)(如Illumina、IonTorrent等)有各自特定設(shè)計(jì)的接頭。這些接頭包含與測(cè)序平臺(tái)的流動(dòng)池(flowcell)表面互補(bǔ)的序列,用于將DNA片段固定在測(cè)序芯片上,還包含用于區(qū)分不同樣本的索引序列(index)等。
連接反應(yīng):使用DNA連接酶將接頭與DNA片段連接。T4DNA連接酶是常用的連接酶,它可以在ATP(三磷酸腺苷)存在下,將接頭的5'-磷酸基團(tuán)與DNA片段的3'-羥基形成磷酸二酯鍵,從而將接頭連接到DNA片段的兩端。連接反應(yīng)的條件(如溫度、連接酶的用量、反應(yīng)時(shí)間等)需要根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)要求進(jìn)行優(yōu)化,以確保較高的連接效率。 NGS測(cè)序是二代測(cè)序嗎?
一代、二代、三代測(cè)序的區(qū)別分別是什么?
一代測(cè)序是上世紀(jì)70年代由Sanger和Coulson開創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測(cè)序,也稱為Sanger測(cè)序。
二代測(cè)序技術(shù)(NGS)是為了改進(jìn)一代測(cè)序通量過低的問題而出現(xiàn)的,能夠同時(shí)對(duì)上百萬甚至數(shù)十億個(gè)DNA分子進(jìn)行測(cè)序?qū)崿F(xiàn)了大規(guī)模、高通量測(cè)序的目標(biāo)。
三代測(cè)序主要有兩種技術(shù)PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore 的納米孔單分子測(cè)序技術(shù),這兩種技術(shù)的測(cè)序讀長都可以達(dá)到幾-kb的級(jí)別,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測(cè)序技術(shù)。 二代測(cè)序是為了改進(jìn)一代測(cè)序通量過低的問題而出現(xiàn)的。北京二代測(cè)序運(yùn)用
二代測(cè)序結(jié)果怎么分析?云南嘉安健達(dá)二代測(cè)序運(yùn)用
二代測(cè)序——技術(shù)原理類問題
二代測(cè)序與一代測(cè)序的區(qū)別是什么:一代測(cè)序技術(shù)如Sanger測(cè)序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準(zhǔn)確性高,適用于對(duì)少量基因片段的精確測(cè)序。而二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可以同時(shí)對(duì)大量DNA分子進(jìn)行測(cè)序,但在單個(gè)堿基的準(zhǔn)確性上稍低于一代測(cè)序,二者在不同的應(yīng)用場(chǎng)景中各有優(yōu)勢(shì)。二代測(cè)序有哪些主要的測(cè)序原理:主要包括邊合成邊測(cè)序和連接法測(cè)序。邊合成邊測(cè)序是在DNA聚合酶的作用下,逐個(gè)添加帶有熒光標(biāo)記的dNTP,通過檢測(cè)釋放的熒光信號(hào)來確定堿基序列;連接法測(cè)序則是利用DNA連接酶將寡核苷酸探針連接到模板DNA上,根據(jù)連接的探針序列來推斷模板DNA的堿基組成。 云南嘉安健達(dá)二代測(cè)序運(yùn)用