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吉林二代測序原理

來源: 發(fā)布時間:2024-12-17

什么樣本可以做二代測序?①

1、血液樣本

全血:這是最常見的樣本類型之一。血液中含有白細胞,其細胞核內(nèi)有完整的基因組DNA。通過提取白細胞中的DNA,可以進行全基因組測序、全外顯子組測序等。例如,在遺傳病的基因診斷中,抽取患者的全血,提取DNA后,對與疾病相關(guān)的基因或整個外顯子組進行測序,以尋找致病突變。

血漿/血清:其中含有游離的DNA(cfDNA)和RNA(cfRNA)。在**患者中,腫瘤細胞會釋放其DNA片段進入血液循環(huán),這些cfDNA被稱為循環(huán)**DNA(ctDNA)。通過對血漿中的ctDNA進行測序,可以實現(xiàn)**的早期篩查、***過程中的動態(tài)監(jiān)測等。例如,對于肺*患者,檢測血漿中的ctDNA來追蹤**的基因突變情況,為靶向***提供依據(jù)。 二代測序廣泛應(yīng)用于個性化醫(yī)學(xué)。吉林二代測序原理

吉林二代測序原理,二代測序

二代測序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異③

孕婦及胎兒

優(yōu)勢:無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(NIPT)是二代測序技術(shù)用于孕期胎兒常見染色體非整倍體篩查的應(yīng)用,對于唐氏綜合征、18-三體綜合征、13-三體綜合征等染色體異常疾病的檢測準(zhǔn)確率分別能達到95%、85%、75%以上,明顯高于傳統(tǒng)血清學(xué)篩查。

局限性:孕婦外周血中胎兒游離DNA來源于胎盤滋養(yǎng)細胞,可能與胎兒實際情況不一致,導(dǎo)致假陽性。母親若合并免疫疾病、凝血功能障礙等,會使外周血中游離DNA含量過高,掩蓋胎兒來源的游離DNA,造成假陰性510. 河南哪里有二代測序公司二代測序的優(yōu)勢是高準(zhǔn)確性。

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一代、二代、三代測序的技術(shù)原理和技術(shù)特點分別是什么?

技術(shù)原理:

一代—雙脫氧終止法

二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像

三代—PacBio SMRT測序技術(shù)

技術(shù)特點:

一代—只能檢測序列一致的PCR產(chǎn)物;讀長可以較長,比如Sanger可以達到幾百bp;通量低,一次只能檢測少量的序列;成本低;

二代—可以并行測序;需要放大信號才能檢測;通量大,可以產(chǎn)生上G的reads;讀長較短,一-般是固定的,比如50、100、150、250等;成本較高

三代:可以并行測序;不需要放大信號,對單個分子進行測序;通量大,比如SequelII平臺,一張芯片可以有800萬個ZMW;讀長較長;測序精確度較差;成本高;

二代測序的建庫步驟③

三、末端修復(fù)和加A尾(以DNA文庫為例)

末端修復(fù):經(jīng)過片段化后的DNA末端可能是不平齊的,有5'-突出端或3'-突出端。末端修復(fù)反應(yīng)可以利用T4DNA聚合酶、Klenow片段等酶,將這些末端補平,使其成為平末端。T4DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,在合適的反應(yīng)緩沖液和dNTP(脫氧核糖核苷三磷酸)存在下,可以將突出的末端補平。

加A尾:在末端修復(fù)后的平末端DNA分子的3'-末端加上一個A堿基。這一步是為了后續(xù)連接帶有T-突出端的接頭做準(zhǔn)備,一般使用Klenow片段(3'→5'外切酶活性缺失)在dATP存在下進行加A反應(yīng),這樣可以使DNA片段能夠高效地與帶有T-突出端的測序接頭連接。 二代測序的工作原理是什么?

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二代測序技術(shù)的一些***研究進展①

疾病診斷與***領(lǐng)域 :消化系統(tǒng)**標(biāo)志物檢測:2024 年的**共識指出,二代測序(NGS)技術(shù)可同時檢測消化系統(tǒng)**中的多種標(biāo)志物,如錯配修復(fù)基因變異、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)狀態(tài)、**突變負荷(TMB)等,為**的精細***提供了更***、準(zhǔn)確的信息。例如,MSI-H 的實體瘤患者可使用帕博利珠單抗進行***,而 NGS 技術(shù)能更好地檢測 MSI 狀態(tài)及相關(guān)耐藥機制。

**液體活檢:通過檢測血液中的循環(huán)** DNA(ctDNA)等標(biāo)志物,實現(xiàn)對**的早期篩查、診斷和***監(jiān)測。NGS 技術(shù)能夠更敏感地檢測到 ctDNA 中的基因突變和變異,為**的無創(chuàng)診斷提供了有力支持。


二代測序產(chǎn)出的數(shù)據(jù)量有多少?黑龍江二代測序流程

二代測序使用的是哪種設(shè)備?吉林二代測序原理

二代測序——蛋白質(zhì)甲基化

概念及位置:蛋白質(zhì)甲基化是指在蛋白質(zhì)的氨基酸殘基上添加甲基基團。常見的甲基化修飾位點包括精氨酸(Arg)和賴氨酸(Lys)殘基。

作用

1、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用:例如,組蛋白(染色體的組成成分)的甲基化可以改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,影響基因的可及性。當(dāng)組蛋白 H3 的賴氨酸殘基(如 H3K4、H3K9 等)發(fā)生甲基化時,會招募不同的蛋白質(zhì)復(fù)合物,從而***或抑制基因轉(zhuǎn)錄。2、調(diào)節(jié)酶的活性:某些酶的活性可以通過蛋白質(zhì)甲基化來調(diào)節(jié)。甲基化可能改變酶的活性中心的結(jié)構(gòu)或者影響其與底物的結(jié)合能力。

檢測方法:質(zhì)譜分析:這是一種***用于檢測蛋白質(zhì)甲基化的方法。它能夠精確地確定蛋白質(zhì)分子的質(zhì)量,通過比較甲基化和未甲基化蛋白質(zhì)的質(zhì)譜圖,可以鑒定甲基化位點和修飾程度。 吉林二代測序原理

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標(biāo)簽: 二代測序