不同二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)的速度

Illumina 測(cè)序平臺(tái)：這是目前市場(chǎng)上應(yīng)用較為***的二代測(cè)序平臺(tái)之一，其測(cè)序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列，一次運(yùn)行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù)，通量可達(dá)數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長(zhǎng)，能夠滿足大規(guī)模基因組學(xué)研究和臨床檢測(cè)的需求。

Roche 454 測(cè)序平臺(tái)：Roche 454 測(cè)序系統(tǒng)的測(cè)序速度也較快，其特點(diǎn)是測(cè)序片段比較長(zhǎng)，高質(zhì)量的讀長(zhǎng)能達(dá)到 400bp 左右，一次運(yùn)行可以在 24 小時(shí)左右完成對(duì)一定數(shù)量樣本的測(cè)序。

BGISEQ 系列：華大智造的 BGISEQ 系列測(cè)序儀在速度上也有出色表現(xiàn)，如全球二代測(cè)序速度**快設(shè)備 E25 量產(chǎn)，為快速測(cè)序提供了有力支持 什么是二代測(cè)序技術(shù)？靜安區(qū)哪里有二代測(cè)序技術(shù)

二代測(cè)序的建庫(kù)步驟⑤

五、文庫(kù)富集（可選步驟）

PCR富集：對(duì)于一些起始樣本量較少或者連接效率較低的情況，可能需要進(jìn)行PCR富集。利用與接頭序列互補(bǔ)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，增加文庫(kù)中目標(biāo)DNA片段的數(shù)量。在PCR反應(yīng)中，需要注意引物的設(shè)計(jì)要與接頭序列準(zhǔn)確匹配，并且要優(yōu)化PCR循環(huán)數(shù)，避免過(guò)度擴(kuò)增導(dǎo)致文庫(kù)多樣性降低或引入PCR偏差。一般會(huì)通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定合適的PCR循環(huán)數(shù)，例如從10-15個(gè)循環(huán)開(kāi)始嘗試，通過(guò)檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的量和質(zhì)量來(lái)調(diào)整循環(huán)數(shù)。 二代測(cè)序技術(shù)二代測(cè)序廣泛應(yīng)用于個(gè)性化醫(yī)學(xué)。

一代、二代、三代測(cè)序的技術(shù)原理和技術(shù)特點(diǎn)分別是什么？

技術(shù)原理：

一代—雙脫氧終止法

二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像

三代—PacBio SMRT測(cè)序技術(shù)

技術(shù)特點(diǎn)：

一代—只能檢測(cè)序列一致的PCR產(chǎn)物；讀長(zhǎng)可以較長(zhǎng)，比如Sanger可以達(dá)到幾百bp；通量低，一次只能檢測(cè)少量的序列；成本低；

二代—可以并行測(cè)序；需要放大信號(hào)才能檢測(cè)；通量大，可以產(chǎn)生上G的reads；讀長(zhǎng)較短，一-般是固定的，比如50、100、150、250等；成本較高

三代：可以并行測(cè)序；不需要放大信號(hào)，對(duì)單個(gè)分子進(jìn)行測(cè)序；通量大，比如SequelII平臺(tái)，一張芯片可以有800萬(wàn)個(gè)ZMW；讀長(zhǎng)較長(zhǎng)；測(cè)序精確度較差；成本高；

二代測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域有哪些？

基因組學(xué)研究：用于全基因組測(cè)序，快速獲取物種的基因組序列信息，研究基因組結(jié)構(gòu)、變異、進(jìn)化等；進(jìn)行全外顯子組測(cè)序，重點(diǎn)關(guān)注編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域，發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的基因突變。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究：通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序，可分析基因的表達(dá)水平、可變剪接、新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)等，有助于深入了解基因在不同生理和病理狀態(tài)下的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。

疾病診斷與***：在遺傳病診斷中，能夠檢測(cè)出導(dǎo)致遺傳病的基因突變，為疾病的診斷、遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷提供依據(jù)；在**研究中，可分析腫瘤細(xì)胞的基因突變、拷貝數(shù)變異、基因融合等，為**的早期診斷、靶向***和預(yù)后評(píng)估提供支持。

藥物研發(fā)：用于藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證，通過(guò)分析疾病相關(guān)的基因變異和表達(dá)變化，確定潛在的藥物作用靶點(diǎn)；還可進(jìn)行藥物基因組學(xué)研究，預(yù)測(cè)患者對(duì)藥物的反應(yīng)和不良反應(yīng)，實(shí)現(xiàn)個(gè)體化藥物***。

微生物學(xué)研究：對(duì)微生物群落進(jìn)行宏基因組測(cè)序，無(wú)需培養(yǎng)即可分析微生物的種類(lèi)、豐度和功能基因，了解微生物群落的結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)變化，研究微生物與宿主的相互作用，以及在環(huán)境科學(xué)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用

二代測(cè)序的優(yōu)勢(shì)是高靈敏度。

二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異②

遺傳病患者及攜帶者

優(yōu)勢(shì)：在常見(jiàn)單基因遺傳病如囊性纖維化、鐮狀細(xì)胞貧血等的檢測(cè)中，二代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性高，能夠快速、準(zhǔn)確地找到致病基因，對(duì)于有家族遺傳病史的人群，可有效確定是否攜帶致病基因，評(píng)估生育患病后代的風(fēng)險(xiǎn)。

局限性：對(duì)于罕見(jiàn)遺傳病，由于基因突變的多樣性和復(fù)雜性，可能存在部分致病基因未被覆蓋或難以準(zhǔn)確解讀的情況，導(dǎo)致準(zhǔn)確性有所降低。此外，即使檢測(cè)結(jié)果為陰性，也不能完全排除患病可能，因部分遺傳病可能由未知基因突變或基因與環(huán)境相互作用引起2 二代測(cè)序可以應(yīng)用在哪些方面？山東哪里有二代測(cè)序流程

二代測(cè)序需要分析嗎？靜安區(qū)哪里有二代測(cè)序技術(shù)

一代、二代、三代測(cè)序的區(qū)別分別是什么？

一代測(cè)序是上世紀(jì)70年代由Sanger和Coulson開(kāi)創(chuàng)的DNA雙脫氧鏈終止法測(cè)序，也稱(chēng)為Sanger測(cè)序。

二代測(cè)序技術(shù)(NGS)是為了改進(jìn)一代測(cè)序通量過(guò)低的問(wèn)題而出現(xiàn)的，能夠同時(shí)對(duì)上百萬(wàn)甚至數(shù)十億個(gè)DNA分子進(jìn)行測(cè)序?qū)崿F(xiàn)了大規(guī)模、高通量測(cè)序的目標(biāo)。

三代測(cè)序主要有兩種技術(shù)PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore 的納米孔單分子測(cè)序技術(shù)，這兩種技術(shù)的測(cè)序讀長(zhǎng)都可以達(dá)到幾-kb的級(jí)別，遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測(cè)序技術(shù)。 靜安區(qū)哪里有二代測(cè)序技術(shù)

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