生化模式凈水主要是靠硝化細(xì)菌，硝化細(xì)菌從無到有這個(gè)過程俗稱掛膜。硝化細(xì)菌掛膜需要濾材（細(xì)菌屋）；硝化細(xì)菌屬于好氧細(xì)菌，因此需要氧氣；硝化細(xì)菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個(gè)情況下，保持25度水溫，硝化細(xì)菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個(gè)過程叫冷啟動(dòng)。想快速啟動(dòng)，可以使用液體硝化細(xì)菌，或者添加一些其他已經(jīng)掛膜的濾材進(jìn)來進(jìn)行引菌，這個(gè)過程叫熱啟動(dòng)。海水系統(tǒng)應(yīng)為高鹽度的問題，自然掛膜時(shí)間比淡水系統(tǒng)要長一倍以上，時(shí)間也隨鹽度升高而延長。

循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)作為一種新型養(yǎng)殖模式，通過一系列水處理單元將養(yǎng)殖池中產(chǎn)生的殘餌糞便、氨氮（TAN）、亞硝(xiao)酸鹽氮（NO2–N）等有害污染物加以去除,凈化養(yǎng)殖水體環(huán)境為目的，利用物理過濾、生物過濾、去除CO2、消毒、增氧、調(diào)溫等處理將凈化后的水體重新輸入養(yǎng)殖池的過程。其不僅可以解決水資源利用率低的問題，還可以為養(yǎng)殖生物提供穩(wěn)定可靠、舒適優(yōu)質(zhì)的生活環(huán)境，為高密度養(yǎng)殖提供了有利條件。

生化過濾依靠的是硝化細(xì)菌，硝化細(xì)菌的數(shù)量直接影響凈水效能。硝化細(xì)菌的數(shù)量和濾材的表面積有關(guān)：表面積越大就能附著越多的硝化細(xì)菌。有資料顯示，火山石的比表面積是300平方米/立方，K1是500平方米/立方。還有一種micro k1的東西，國內(nèi)電商平臺(tái)上面沒有見過，比表面積是950平方米/立方。常見的過濾還有沼澤過濾，這個(gè)屬于是被動(dòng)過濾，濾材上的硝化細(xì)菌因?yàn)榈貌坏阶銐虻难鯕?，硝化反?yīng)比較慢，大多數(shù)商超暫養(yǎng)用的就是這種過濾，優(yōu)點(diǎn)是建造完成后基本無需維護(hù)。